养鱼和公司签订的有偿使用饲料协议，在符合法律规定且双方意思表示真实的情况下，是有效的。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议有效的法律基础
合同成立要件：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同成立需要满足双方意思表示真实、内容合法、不违反公序良俗等基本条件。在您描述的情境中，如果养鱼方与公司就饲料的有偿使用达成了合意，且该合意不违反法律法规的强制性规定，那么该协议在法律上即视为成立。
合同效力认定：合同成立后，其效力取决于是否满足法律规定的生效要件。一般来说，只要合同内容合法、双方意思表示真实且没有欺诈、胁迫等情形，合同即具有法律效力。因此，在您的情况下，如果协议内容合法且双方自愿签订，那么该协议是有效的。
二、协议有效性的具体分析
协议内容合法性：协议内容必须合法，不得违反国家法律法规的强制性规定。例如，协议中不得约定使用非法饲料或进行非法养殖活动等。如果协议内容合法，那么该协议在法律上即具有有效性。
双方意思表示真实性：双方签订协议时必须意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在签订协议时存在欺诈或胁迫行为，那么该协议可能因意思表示不真实而被认定为无效或可撤销。
协议形式要件：虽然法律对某些合同的形式有特定要求（如书面形式），但对于一般的饲料使用协议，法律并未规定必须采用特定形式。因此，只要双方能够就协议内容达成一致，并可以通过口头或书面形式固定下来，该协议即具有法律效力。不过，为了保障双方权益，建议采用书面形式签订协议，并明确约定双方的权利和义务。
三、可能影响协议有效性的因素及建议
饲料质量问题：如果协议中约定的饲料存在质量问题，导致养鱼方遭受损失，那么养鱼方有权要求公司承担违约责任或赔偿责任。因此，在签订协议时，建议明确约定饲料的质量标准、检验方法以及违约责任等条款。
协议履行过程中的变更与解除：在协议履行过程中，如果双方需要变更或解除协议，应当协商一致并签订书面变更或解除协议。未经协商一致擅自变更或解除协议的，可能构成违约行为，需要承担相应的法律责任。
争议解决方式：为了保障双方权益，建议在协议中明确约定争议解决方式（如协商、调解、仲裁或诉讼等）。这样，在发生争议时，双方可以按照约定方式解决争议，避免不必要的法律纠纷。
如果您在签订或履行有偿使用饲料协议过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律服务。