针对您提出的“已经经过验收合格的房屋，经鉴定存在安全问题怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，当房屋经过验收合格后又被鉴定出存在安全问题，这是一个需要高度重视的情况。根据相关规定和实际操作流程，您可以按照以下步骤来处理：

1. 确认鉴定结果：

   • 确保鉴定是由具有相应资质的正规鉴定机构进行的，并获取详细的鉴定报告。
   • 仔细阅读鉴定报告，了解房屋存在的具体安全问题、严重程度以及建议的处理措施。

2. 根据鉴定结果采取相应措施：

   • 观察使用：如果鉴定单位认为房屋还能短期使用，但需采取安全技术措施并继续观察，您应按照建议立即采取必要的安全技术措施，如加固、支撑等，并定期观察房屋状况。
   • 处理使用：若鉴定单位提出采取技术措施后可解除危险，您应尽快联系专业施工队伍，按照鉴定报告中的建议进行修缮或加固处理。
   • 停止使用：如果房屋已无修缮价值，暂时不便拆除，且不危及相邻建筑和他人安全，您应立即停止使用该房屋，并设置明显的警示标志，防止他人误入。
   • 整体拆除：若整幢房屋危险且无修缮价值，需立即拆除的，您应尽快联系相关部门办理拆除手续，并委托有资质的拆除队伍进行拆除。
   • 按相关规定处理：对于有特殊规定的房屋，如历史建筑、文物保护单位等，您应按照相关规定进行特殊处理。

3. 报告与核实：

   • 在您采取措施消除安全隐患后，应向房屋所在地街道办事处报告，并提供相关证明材料。
   • 街道办事处会核实您所采取的措施是否有效，并进行信息更新。如果经核实未消除安全隐患，街道办事处会督促您继续消除安全隐患。

4. 综合治理与查处：

   • 对于逾期未整改的危险房屋，街道办事处会联合辖区派出所、社区工作站等街道相关部门和物业服务企业、业主委员会等民事主体进行综合治理。
   • 经综合治理后仍未消除安全隐患的，有关行政主管部门及街道办事处会依法进行查处，包括但不限于罚款、责令限期整改、强制拆除等措施。

5. 法律责任与注意事项：

   • 在治理期间，您作为房屋安全责任人，不得将危房出租、出借或用于生产经营活动，以免给他人带来安全隐患。
   • 如果因您的疏忽或故意行为导致房屋安全事故发生，您可能需要承担相应的法律责任。

综上所述，当已经经过验收合格的房屋经鉴定存在安全问题时，您应立即确认鉴定结果，并根据鉴定结果采取相应的处理措施。同时，及时向相关部门报告并配合综合治理工作，以确保房屋安全并避免法律责任。希望这些建议能对您有所帮助。