员工在上班途中乘车遭遇车祸受伤，确实是一件令人担忧的事情，但请放心，我们可以按照以下步骤来处理，以确保您的合法权益得到充分保障。

一、立即报警与寻求医疗救助

1. 确保安全：首先，要确保自己的安全，如果可能的话，移动到安全的地方，避免二次伤害。
2. 报警：立即拨打122报警电话，报告事故情况，等待交警到来处理。
3. 医疗救助：同时，拨打120急救电话，寻求医疗救助。即使感觉伤势不重，也应进行全面检查，并保留好医疗证明和报告，这些将作为后续索赔的重要依据。

二、保护现场与收集证据

1. 保护现场：在等待交警和救护车的过程中，尽量保护好事故现场，不要随意移动车辆或物品，以便交警进行事故责任认定。
2. 收集证据：如果条件允许，可以拍摄现场照片或视频，记录事故发生的经过和现场情况。这些证据将对后续的法律程序和索赔起到关键作用。

三、通知单位与了解保险

1. 通知单位：及时通知工作单位，告知因车祸受伤无法正常工作，并了解单位是否购买了工伤保险，以便后续进行工伤认定和申请工伤待遇。
2. 了解保险：如果自己或对方车辆有保险，也应了解保险情况，以便在后续处理中能够及时获得赔偿。

四、交通事故处理与责任认定

1. 配合交警调查：如实向交警陈述事故发生经过，提供相关线索和证据，如事故现场照片、行车记录仪内容等。
2. 等待责任认定：等待交警出具交通事故责任认定书，这是确定事故责任的重要依据。根据责任认定书，您可以了解自己在事故中的责任比例。

五、工伤认定与待遇申请

1. 判断是否符合工伤条件：根据《工伤保险条例》，在上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害，应认定为工伤。请确保自己在事故中不是承担主要责任，才符合工伤认定条件。
2. 申请工伤认定：单位应在事故伤害发生之日起30日内提出工伤认定申请；若单位未申请，您个人可在1年内直接申请。申请时需提供工伤认定申请表、劳动关系证明材料、医疗诊断证明、交通事故责任认定书等。
3. 劳动能力鉴定与待遇享受：伤情稳定后，如果存在残疾或影响劳动能力的情况，应进行劳动能力鉴定。根据鉴定结果，您可以享受相应的工伤待遇，包括医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴等。

六、交通事故索赔与双重赔偿

1. 与对方协商赔偿：根据事故责任认定书，您可以与对方协商赔偿事宜，包括医疗费、误工费、护理费等各类合理费用。
2. 调解与诉讼：如果协商不成，您可以向交警部门申请调解，或在律师指导下提起民事诉讼。
3. 双重赔偿问题：在我国，交通事故赔偿与工伤赔偿的关系因地区而异。一般原则上，除医疗费等实际发生的费用不能重复赔偿外，其他如伤残赔偿金、一次性工伤医疗补助金等项目可以兼得。因此，请保留好所有相关证据，以便在交通事故索赔和工伤赔偿中分别主张权益。

七、法律咨询与建议

在整个处理过程中，我建议您联系专业律师进行咨询，获取专业的法律建议和指导。律师将能够根据您的具体情况，为您提供更详细、更具体的法律建议和帮助。

总之，员工在上班途中乘车遭遇车祸受伤后，应冷静应对，按照上述步骤逐一处理。同时，也要保持与单位和保险公司的沟通，确保自己的合法权益得到充分保障。希望您能够早日康复，并顺利解决后续问题。