结论：公司设立的工会是否可以在本公司做账，需分情况讨论，若工会具备独立法人资格，则应独立建账，不能在本公司做账；若工会不具备独立法人资格，虽可由公司财务代管部分事务，但工会经费仍需独立核算，且需严格遵守相关财务规定。以下为详细分析：
一、工会具备独立法人资格的情况
根据《中华人民共和国工会法》及相关规定，若工会具备独立法人资格，那么它应当独立建账，进行独立的财务管理和会计核算。这是因为独立法人资格意味着工会具有独立的民事权利能力和行为能力，能够独立承担民事责任。因此，在这种情况下，工会不能在本公司做账，而应建立自己的财务账目，进行独立的财务核算。
二、工会不具备独立法人资格的情况
若工会不具备独立法人资格，那么它可能无法独立建账和进行财务管理。在这种情况下，工会可以委托公司财务部门代管部分财务事务，如工会经费的收缴、管理等。但即便如此，工会经费的使用和管理仍需严格遵守相关财务规定和工会章程，确保工会经费的独立性和专款专用。同时，公司财务部门在代管工会财务时，也应明确区分公司财务和工会财务，避免混淆和挪用。
三、实际操作中的注意事项
明确工会财务的独立性：无论工会是否具备独立法人资格，都应确保工会财务的独立性。这包括建立独立的财务账目、进行独立的财务核算、制定独立的财务制度等。
遵守相关财务规定：工会在进行财务管理和会计核算时，应严格遵守国家相关的财务规定和工会章程。这有助于确保工会财务的合法性和规范性，避免不必要的法律风险。
加强内部监督和管理：工会应建立健全内部监督和管理机制，对工会经费的收缴、使用和管理进行严格的监督和审查。这有助于确保工会经费的合理使用和有效管理，维护工会的合法权益。
四、法律后果
如果工会未按照相关规定进行独立的财务管理和会计核算，或者挪用、侵占工会经费，那么可能会面临法律责任。这包括但不限于被要求返还挪用、侵占的经费、承担民事赔偿责任等。同时，相关责任人员也可能面临行政处分或刑事责任等法律后果。
建议：公司在设立工会时，应明确工会的法律地位和财务独立性。如果工会具备独立法人资格，则应独立建账、独立核算；如果不具备独立法人资格，则应委托公司财务部门代管部分财务事务，但需确保工会经费的独立性和专款专用。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。