针对农村非法占地问题，应向以下部门进行举报和管理，具体依据非法占地的性质和情况而定：

1. 县级以上人民政府自然资源主管部门

   • 主要职责：作为土地管理的核心部门，自然资源主管部门负责全面监督土地使用情况，对未经批准或骗取批准非法占用土地的行为进行严厉查处。这包括责令退还土地、限期拆除违法建筑、没收地上建筑物以及处以罚款等行政处罚。
   • 应用场景：适用于所有类型的非法占用土地行为，特别是擅自改变土地用途、未批先用、少批多用等情况。例如，如果有人在农村未经批准擅自占用耕地建设工厂或住宅，就应向自然资源主管部门举报。

2. 县级农业农村主管部门

   • 主要职责：专注于农村宅基地的管理，特别是查处农村村民非法占用土地建住宅的行为。农业农村主管部门有权依据相关法律法规责令违法者退还土地，并限期拆除新建房屋。
   • 应用场景：特别针对农村村民非法占用土地建设住宅的情况。比如，村民未经批准在自家承包地上建设住宅，就应向农业农村主管部门反映。

3. 乡（镇）政府或街道办事处

   • 主要职责：作为基层管理单位，乡（镇）政府或街道办事处积极参与土地违法案件的查处与处理。部分省份已将部分县级部门的行政处罚权下放至乡镇和街道，使其在法律框架内具备相应的执法权限。
   • 应用场景：适用于农村村民在乡村规划区内未经许可占用土地建设房屋，且该建设行为违反了乡村建设规划的情况。例如，村民在乡村规划区内擅自占用土地建设房屋，且未按照规划要求进行建设，就应向乡（镇）政府或街道办事处举报。

举报与处理流程：

• 举报方式：发现农村非法占地行为后，应向当地自然资源主管部门、农业农村主管部门或乡（镇）人民政府进行举报。举报时，可以尽量提供详实的证据和信息，如非法占用土地的具体位置、面积、用途以及涉事人员等，以便相关部门能够更有效地进行处理。
• 处理流程：接到举报后，相关部门将依法进行调查、取证，并根据调查结果采取相应的法律措施。如果举报内容属实，相关部门将责令停止违法行为、限期拆除违法建筑、恢复土地原状，并对违法者处以罚款等行政处罚。

法律后果与建议：

• 法律后果：非法占用土地的行为将受到法律的严厉打击和惩处。根据违法情节的轻重，违法者可能面临责令退还土地、限期拆除违法建筑、没收地上建筑物以及处以罚款等行政处罚。如果情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。
• 建议：为了维护自身的合法权益和土地资源的合法合规使用，公众应积极参与监督，发现非法占地行为及时举报。同时，在举报前应尽量收集相关证据和信息，以便相关部门能够更有效地进行处理。如果遇到复杂的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。

综上所述，农村非法占地问题应向县级以上人民政府自然资源主管部门、县级农业农村主管部门或乡（镇）政府或街道办事处进行举报和管理。各部门将依法履行职责，共同维护土地的合法使用秩序。