非法用地的问题主要由自然资源主管部门负责管理。以下是对此问题的详细分析：

1. 管理部门的确定：

   • 根据相关法律法规，自然资源主管部门是负责土地管理和监督的主要部门。这包括了对土地使用情况的监管，以及对非法用地行为的查处。

2. 非法用地的定义与类型：

   • 非法用地通常指的是未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的行为。这包括但不限于未经批准擅自占用土地、超过批准的数量占用土地、以及改变土地用途等行为。

3. 管理部门的职责与权力：

   • 自然资源主管部门有权对非法用地行为进行调查、取证，并根据调查结果作出相应的行政处罚决定。这可能包括责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状，以及罚款等。

4. 其他相关部门的协作：

   • 在处理非法用地问题时，自然资源主管部门可能会与其他相关部门（如城乡规划部门、建设部门等）进行协作，共同打击非法用地行为，维护土地管理秩序。

5. 法律后果与救济途径：

   • 对于非法用地行为，相关责任人可能会面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任。如果当事人对自然资源主管部门的处罚决定不服，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

建议：

• 如果您发现非法用地行为，可以向当地的自然资源主管部门进行举报，他们会依法进行调查处理。
• 如果您自己涉及非法用地问题，建议尽快咨询专业律师，了解自己的法律责任和可能的法律后果，以便及时采取措施进行纠正和补救。

如果您在非法用地方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。