在问责案件中，一般不能只追究领导责任而不追究直接责任，但具体需根据案件实际情况和法律规定来判断。以下从多个角度进行分析：

一、法律原则层面

1. 责任自负原则：法律责任应当由违法行为人或违约行为人自己承担，这是法律责任的基本原则。在问责案件中，如果直接责任人实施了违法行为或违约行为，那么其应当承担相应的法律责任，不能因其领导的存在或领导责任的存在而免除其直接责任。
2. 过错与责任相适应原则：法律责任的承担应当与行为人的过错程度相适应。在问责案件中，如果直接责任人的过错程度明显大于领导责任人的过错程度，那么直接责任人应当承担更重的法律责任，而不能仅追究领导责任人的责任。

二、具体法律规定层面

1. 行政问责：在行政问责中，通常会对直接责任人和领导责任人分别进行问责。直接责任人因其直接实施了违法行为或不当行为而承担责任，领导责任人则因其未履行好领导职责或管理职责而承担责任。两者并不互相排斥，而是可以并存。
2. 刑事责任：在刑事案件中，如果直接责任人实施了犯罪行为，那么其应当承担刑事责任。领导责任人如果也参与了犯罪行为或存在失职、渎职等行为，同样应当承担相应的刑事责任。刑事责任的追究是严格的，不会因领导责任的存在而免除直接责任人的刑事责任。
3. 民事责任：在民事纠纷中，如果直接责任人的行为导致了损害结果的发生，那么其应当承担民事赔偿责任。领导责任人如果存在过错或未履行好管理职责，也可能需要承担一定的民事责任，但这并不免除直接责任人的民事责任。

三、实际操作层面

1. 证据收集与认定：在问责案件中，需要收集充分的证据来认定直接责任人和领导责任人的责任。如果证据只能证明领导责任人的责任而无法证明直接责任人的责任，那么可能只能追究领导责任人的责任。但这并不意味着在证据充分的情况下可以只追究领导责任而不追究直接责任。
2. 问责程序的公正性：问责程序应当公正、透明，确保每个责任人都能够得到公正的对待。在问责过程中，应当充分听取直接责任人和领导责任人的陈述和申辩，确保问责结果的公正性和合理性。

建议：在问责案件中，应当全面、客观地认定直接责任人和领导责任人的责任，并根据法律规定和案件实际情况进行公正的问责。如果直接责任人实施了违法行为或违约行为，那么其应当承担相应的法律责任，不能因其领导的存在或领导责任的存在而免除其直接责任。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。