事业单位在编员工自动离职后，一般情况下与原单位的人事关系即行终止，但具体还需根据离职程序和单位规定来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 自动离职的法律后果：

   • 自动离职通常指的是员工未按照法定程序或单位规定，擅自离开工作岗位的行为。在事业单位中，这种行为往往被视为对人事关系的单方面解除。
   • 根据相关法律法规及事业单位人事管理规定，员工自动离职后，原单位一般会按照相关规定办理离职手续，包括停发工资、福利，转移档案等，从而终止与该员工的人事关系。

2. 离职程序的重要性：

   • 尽管自动离职可能导致人事关系的终止，但离职程序的合规性仍然至关重要。如果员工未按照单位规定或法律法规的要求办理离职手续，可能会面临一些不利后果，如档案无法顺利转移、社保关系中断等。
   • 因此，即使员工打算自动离职，也建议尽量与单位协商，按照正规程序办理离职手续，以确保自身权益不受损害。

3. 单位规定的影响：

   • 不同的事业单位可能有不同的离职规定和程序。有些单位可能对自动离职有更为严格的处理措施，如要求员工承担一定的违约责任或赔偿损失。
   • 因此，在自动离职前，员工应仔细阅读单位的相关规定，了解离职的具体要求和后果，以便做出明智的决策。

4. 特殊情况下的处理：

   • 在某些特殊情况下，如员工因病或因公受伤无法继续工作，且未按照正规程序办理离职手续的，单位可能会根据实际情况给予一定的照顾或处理。
   • 但这种情况下的处理往往需要员工提供充分的证据和理由，并经过单位的审核和批准。

建议：

• 对于事业单位在编员工而言，如果打算离职，最好与单位进行充分沟通，了解离职的具体要求和程序，并按照正规流程办理离职手续。
• 如果已经自动离职且担心与原单位的人事关系问题，可以主动与单位联系，了解离职手续的办理情况，并咨询是否需要补充相关材料或履行其他义务。

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