结论：执业药师离职后，若其证书仍留在公司，是否享有药师费需根据具体情况判断，主要包括是否与公司存在明确的药师费约定、证书使用情况以及离职时的相关协议等因素。

分析说明：

1. 存在明确药师费约定的情况：

   • 如果执业药师在在职期间与公司有明确的约定，即其证书在公司使用期间，公司需支付一定的药师费，那么这种约定在离职后，若证书仍被公司使用，理论上药师仍有权要求公司继续支付药师费，除非双方另有约定或法律另有规定。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者与用人单位可以就劳动报酬、福利待遇等事项进行协商并达成协议。若药师费作为福利待遇的一部分，且双方有明确约定，则应受法律保护。

2. 无明确药师费约定，但证书被公司使用的情况：

   • 如果执业药师与公司在职期间没有明确的药师费约定，但离职后证书仍被公司使用，药师是否有权要求支付药师费则存在争议。这通常取决于证书使用的性质、目的以及是否给药师造成了实际损失等因素。
   • 法律建议：在这种情况下，药师可以尝试与公司协商，要求公司停止使用其证书或支付一定的使用费。如果协商不成，药师可以考虑通过法律途径解决，但需注意收集相关证据，如证书使用记录、公司盈利情况等，以支持其主张。

3. 离职时已明确证书使用及费用问题的情况：

   • 如果执业药师在离职时，已与公司就证书的使用及费用问题达成明确协议，如证书归还、不再使用或支付一定费用等，则应按照协议执行。
   • 法律提示：离职协议是双方自愿达成的，具有法律约束力。因此，药师在签署离职协议时，应仔细阅读协议内容，确保自己的权益得到保障。

特殊场景：

• 如果执业药师离职后，公司未经其同意擅自使用其证书进行非法活动或谋取不正当利益，药师不仅有权要求公司停止使用其证书，还有权要求公司承担相应的法律责任。

行动建议：

• 执业药师在离职前，应与公司就证书的使用及费用问题进行明确约定，并签署书面协议。
• 离职后，如发现公司擅自使用其证书，应及时与公司沟通并要求停止使用。如沟通无果，可考虑通过法律途径解决。
• 在处理此类问题时，建议执业药师咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和支持。

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