带薪休假并不纳入综合工时的总工时计算。以下是对这一问题的详细解析：
一、带薪年休假与综合工时制的关系
适用条件：根据《职工带薪年休假条例》及相关法律法规，无论是标准工时制还是综合工时制，只要职工在用人单位连续工作满1年，即可享受带薪年休假。这意味着，综合工时制并不影响职工依法享有的带薪年休假权益。
年休假天数：年休假天数的确定与职工的累计工作时间有关，而与工时制度无关。具体来说，职工累计工作已满1年不满10年的，年休假为5天；已满10年不满20年的，年休假为10天；已满20年的，年休假为15天。
特别说明：在综合工时制下，虽然工作时间的计算周期与标准工时制不同（如以周、月、季、年为周期综合计算工作时间），但这并不改变职工依法享有的带薪年休假权益。带薪年休假是职工依法享有的休息权利，不应被纳入综合工时的总工时计算。
二、法定节假日的带薪休假与综合工时制
基本规定：在综合工时工作制下，法定节假日同样是带薪休假的。这意味着，即便在综合工时制下，劳动者在法定节假日休息时，用人单位也应按照正常工资标准支付工资，不得扣减。
加班报酬：如果用人单位在法定节假日安排劳动者工作，则需按照法律规定支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这是对劳动者在法定节假日加班的额外补偿，体现了法律对劳动者休息权的保护。这一规定同样适用于综合工时制的职工。
三、其他带薪休假权益
除了带薪年休假和法定节假日的带薪休假外，职工还依法享有其他带薪休假权益，如女职工享有的产假、婚丧假等。这些带薪假期同样适用于综合工时制的职工，用人单位应按照规定予以落实。
四、综合工时制下带薪休假的保障
用人单位应严格按照法律法规的规定，确保综合工时制职工的各项带薪休假权益得到充分保障和落实。这包括合理安排职工的工作时间和休息时间，确保职工在享受带薪休假时不受干扰，以及按照规定支付职工在带薪休假期间的工资等。
总结与建议：
带薪休假是职工依法享有的休息权利，不应被纳入综合工时的总工时计算。无论是带薪年休假、法定节假日的带薪休假还是其他法定带薪假期，都应得到用人单位的充分保障和落实。如果您在综合工时制下遇到带薪休假权益受到侵害的情况，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。