公司制度变更导致离职，员工是否有补偿主要取决于制度变更的性质、劳动合同是否受影响以及离职的具体原因。以下是对此问题的详细分析：
有补偿的情况
公司主动提出解除劳动合同并与员工协商一致：
- 若公司因制度变更主动提出解除劳动合同，并与员工协商一致，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条，公司需按工作年限支付经济补偿。具体标准为：每满一年支付一个月工资，不满半年支付半个月工资。例如，员工在公司工作3年6个月，则公司需支付4个月工资作为经济补偿。
公司制度变更属于客观情况发生重大变化：
- 若公司制度变更（如企业迁移、被兼并等）导致劳动合同无法履行，且双方协商未果，根据《劳动合同法》第四十条第三项，公司在提前通知或额外支付一个月工资后，可解除劳动合同，并需支付经济补偿。此时，经济补偿的计算方式与上述相同。
公司因经营困难等进行裁员：
- 若公司因制度变更导致经营困难，需要进行经济性裁员，根据《劳动合同法》第四十一条，公司需提前说明情况、听取意见，并向劳动行政部门报告，同时向被裁员工支付经济补偿。经济补偿的计算方式依然按照工作年限进行。
公司违法解除劳动合同：
- 若公司因制度变更违法解除劳动合同，如未按照法定程序进行裁员或未支付经济补偿等，根据《劳动合同法》第八十七条，公司需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
没有补偿的情况
员工主动因公司制度变更离职：
- 若公司制度变更并未主动解除劳动合同，而是员工因个人原因（如不适应新制度、岗位调整等）主动离职，则通常无经济补偿。因为根据《劳动合同法》的规定，劳动者主动解除劳动合同，不属于用人单位应当支付经济补偿的法定情形。
公司制度变更未影响劳动合同履行：
- 当公司制度变更未对劳动合同产生实质性影响，员工仍能按原约定提供劳动且公司也按约定支付报酬时，员工以此为由离职并要求赔偿通常不会得到支持。因为此时劳动合同的履行并未受到制度变更的实质性阻碍。
综合建议
- 对于员工而言：在面对公司制度变更时，应首先了解变更的具体内容及其对劳动合同的影响。若认为变更影响了自己的权益，可与公司进行沟通协商，要求公司给予合理的解释和补偿。若协商无果，可依法向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
- 对于公司而言：在制定或变更制度时，应充分考虑员工的权益和利益，确保制度的合法性和合理性。若因制度变更需要解除劳动合同或进行裁员，应按照法定程序进行，并依法支付经济补偿，以避免法律风险和纠纷的发生。
在处理此类问题时，建议双方充分沟通、协商解决，并在必要时寻求专业法律意见以确保合法权益得到充分保护。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。