结论前置：突然不来上班的员工，公司不能随意扣工资，但可以根据具体情况和公司规章制度进行合理处理。
详细分析：
员工突然不来上班的性质：
- 员工突然不来上班，可能构成旷工。旷工是指员工无正当理由，未按照公司规定的时间到岗工作。
- 旷工行为违反了公司的劳动纪律和规章制度，公司有权根据规章制度对员工进行相应的处理。
公司扣工资的法律依据与限制：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，公司不得随意扣除员工的工资。工资是员工提供劳动后应得的报酬，公司应按时足额支付。
- 如果员工因旷工给公司造成了经济损失，公司可以要求员工赔偿，但赔偿金额应从员工工资中扣除时，需遵循一定程序和限制。具体来说，公司应事先与员工协商，并确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。
公司应如何处理员工旷工：
- 规章制度：公司应制定明确的规章制度，规定旷工的处理方式和后果。规章制度应经过民主程序制定，并告知员工。
- 通知与警告：发现员工旷工后，公司应及时通知员工，并要求其说明原因。如果员工无正当理由旷工，公司可以给予警告或记过等处分。
- 解除劳动合同：对于严重旷工或屡教不改的员工，公司有权根据规章制度解除劳动合同。在解除劳动合同前，公司应确保程序合法，如提前通知、听取员工意见等。
特殊情况下的处理：
- 如果员工因突发疾病或意外事件等不可抗力原因无法到岗，且能提供相关证明，公司应给予理解和支持，不应视为旷工。
- 如果员工因公司原因（如工作安排不合理、工作环境恶劣等）导致无法到岗，公司应承担相应责任，并调整工作安排或改善工作环境。
法律建议：
- 公司应制定完善的规章制度，明确旷工的处理方式和后果，并确保规章制度经过民主程序制定并告知员工。
- 在处理员工旷工时，公司应遵循合法、公正、合理的原则，确保程序合法、证据充分。
- 如果员工对公司的处理有异议，公司应积极与员工沟通协商，寻求妥善解决方案。如果无法协商解决，可以寻求劳动争议调解或仲裁机构的帮助。
可能后果：
- 如果公司随意扣除员工工资或违法解除劳动合同，可能面临劳动争议仲裁或诉讼的风险，并可能承担相应的法律责任。
- 员工也可能因公司的违法行为而向劳动监察部门投诉或举报，导致公司受到行政处罚或声誉损失。
因此，公司在处理员工突然不来上班的情况时，应谨慎行事，遵循法律法规和规章制度，确保处理方式合法、公正、合理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。