结论前置：公司去年报销已结算完成，今年因发票上游公司问题要求重新补开，是否合法需分情况讨论。

1. 从发票合规性角度：

   • 根据《中华人民共和国发票管理办法》及相关规定，发票的开具应当真实、合法、有效。如果去年报销时所使用的发票本身存在瑕疵（如上游公司开具的发票不符合规定、存在虚假开具等情况），那么公司有权要求员工重新补开合法有效的发票，以确保报销的合规性。这种情况下，要求补开发票是合法的。

2. 从报销流程与时间角度：

   • 报销流程通常应在费用发生后的一定时间内完成，并且一旦报销完成，一般视为双方对报销事项的认可。如果公司去年已经完成了报销结算，且没有在当时提出发票问题，那么今年再要求补开发票可能涉及报销流程的重新启动和时间的合理性问题。然而，如果公司能够证明去年报销时确实存在发票问题，且该问题是由于上游公司的原因导致的，那么公司要求补开发票仍然具有一定的合理性，但可能需要与员工进行协商，并考虑给予一定的补偿或调整。

3. 从员工权益角度：

   • 员工在报销时应当提供真实、合法、有效的发票。如果员工已经按照公司要求提供了发票，并且公司已经完成了报销结算，那么员工有权认为报销事项已经处理完毕。如果公司今年再要求补开发票，员工有权要求公司说明原因，并考虑是否接受这一要求。如果员工认为公司的要求不合理或侵犯了自己的权益，可以通过与公司协商、向相关部门投诉或寻求法律途径来维护自己的权益。

建议：

• 对于公司而言，应当加强发票管理，确保报销时使用的发票真实、合法、有效。如果发现发票问题，应及时与员工沟通并要求补开，同时考虑给予一定的补偿或调整以维护员工权益。
• 对于员工而言，应当保留好报销时的相关凭证和发票，以便在需要时提供证明。如果公司要求补开发票，员工应与公司进行沟通并了解原因，如果认为公司的要求不合理或侵犯了自己的权益，可以寻求法律途径来维护自己的权益。