当仲裁员在仲裁程序中存在违法行为时，主要可以依据《中华人民共和国仲裁法》以及《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》（如涉及劳动仲裁）的相关规定来处理。以下从不同角度为您详细分析：
一、仲裁员程序违法的常见情形
仲裁庭组成违法：
- 仲裁员选定或指定程序违规，如未按规定方式选定仲裁员，或仲裁员不具备法定资格（如存在回避事由未回避）。
- 法律依据：《中华人民共和国仲裁法》第三十四条，仲裁员有特定情形必须回避，当事人也有权提出回避申请。若仲裁庭组成违反此规定，即构成程序违法。
审理程序违法：
- 仲裁庭未按照法定程序进行审理，如拒绝当事人合理举证请求，或对关键证据未作审查认定。
- 仲裁庭未保障当事人的基本权利，如答辩权、举证权等，或未给予当事人充分的陈述和辩论机会。
- 法律依据：《中华人民共和国仲裁法》及相关仲裁规则中关于审理程序的规定，若仲裁庭违反这些规定，即构成程序违法。
送达程序违法：
- 仲裁文书未按照法定程序送达，如未送达给当事人或送达方式不符合规定，导致当事人未能及时知晓仲裁信息。
- 法律依据：《中华人民共和国仲裁法》及相关仲裁规则中关于送达程序的规定，若违反即构成程序违法。
违反审理期限规定：
- 仲裁庭未在法定期限内作出裁决，如超出规定的审理期限未作裁决。
- 法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十三条，仲裁庭裁决劳动争议案件，应当自受理仲裁申请之日起四十五日内结束，复杂案件可延长十五日。超出此期限未作裁决即构成程序违法。
二、应对仲裁员程序违法的措施
在仲裁程序中提出异议：
- 当事人发现仲裁员存在程序违法行为时，应及时以书面或口头形式向仲裁庭提出异议，说明具体情形和理由，要求纠正。
向仲裁委员会反映：
- 若仲裁庭对异议未予重视或妥善处理，当事人可向仲裁委员会反映情况，请求监督和纠正。
申请撤销仲裁裁决：
- 国内仲裁：根据《中华人民共和国仲裁法》第五十八条，当事人可以提出证据证明裁决存在特定违法情形（如仲裁庭组成或程序违反法定程序），并向仲裁委员会所在地的中级人民法院申请撤销裁决。申请期限为自收到裁决书之日起六个月内。
- 涉外仲裁：依据《中华人民共和国仲裁法》第七十条及《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人可以申请撤销涉外仲裁裁决。申请期限同样为自收到裁决书之日起六个月内。
申请不予执行仲裁裁决：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，被申请人可以提出证据证明仲裁裁决存在特定违法情形，并申请法院裁定不予执行。申请主体一般为仲裁裁决的被申请人，在执行程序中向受理执行申请的法院提出。
提起诉讼：
- 对于某些特定类型的纠纷（如劳动争议），当事人可以在收到仲裁裁决书后的规定期限内（如十五日内）向人民法院提起诉讼。若仲裁裁决被人民法院裁定撤销，当事人也可以就争议事项向人民法院提起诉讼。
三、实际案例与法律后果
- 案例：假设在一起劳动争议仲裁中，仲裁庭未依法回避存在利害关系的仲裁员，且未给予被申请人充分的答辩时间，导致裁决结果不公。被申请人发现后，及时收集证据并向仲裁委员会提出异议，同时向中级人民法院申请撤销仲裁裁决。法院经审查核实后，裁定撤销了该仲裁裁决。
- 法律后果：仲裁员程序违法可能导致仲裁裁决被撤销或不予执行，当事人有权要求重新仲裁或提起诉讼，并有权要求赔偿因程序违法造成的损失。
面对仲裁员程序违法的情况，当事人应保持冷静和理性，通过合法途径积极维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。