当中标通知书与合同内容不一致时，应以何者为准需根据具体情况和法律规定来判断，总体遵循以下规则：合同签订前，以招标文件和中标通知书为准；合同签订后，以合同约定为准，但需特别注意实质性内容的一致性。以下是对此问题的详细分析：

一、合同签订前不一致的处理

1. 情形说明：在中标通知书发出后，正式签订书面合同前发现不一致。
2. 处理依据：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关法律法规，招标人和中标人应按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同，且不得背离合同实质性内容。中标通知书是对中标人承诺的确认，其实质性内容应与招标文件和投标文件保持一致。
3. 处理方式：
   • 实质性内容不一致：若涉及实质性条款（如工程价款、工程期限、质量标准等）的变更，需沟通纠正，以招标文件和投标文件为准。因为这些条款是招投标活动的核心，任何变更都可能影响合同的公平性和履行。
   • 非实质性内容不一致：对于非实质性内容（如通知方式、文件送达地址等）的不一致，可以在双方协商一致的基础上进行调整，但应确保这些调整不影响合同的履行和招投标活动的公平性。

二、合同签订后不一致的处理

1. 情形说明：合同签订后发现合同内容与中标通知书不一致。
2. 一般原则：通常情况下，若合同内容不违反法律法规强制性规定和招投标文件实质性要求，以合同约定为准。因为合同是双方当事人意思表示一致的结果，具有最高的法律约束力。
3. 特殊规定：
   • 实质性内容不一致：若合同中关于不一致内容的条款违反了招投标文件中的实质性内容，则该部分条款可能无效，仍以招投标文件及中标通知书为准。例如，若招标文件规定工程质量标准为优质工程，而合同降低为合格工程，则应遵循招标文件中的优质工程标准。
   • 备案合同优先原则：根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》的相关规定，当事人就同一建设工程另行订立与备案中标合同实质性内容不一致的合同，以备案中标合同为结算工程价款的根据。因此，当合同已经过备案，且备案合同与中标通知书或后续签订的合同存在不一致时，以备案合同为准。

三、实际案例与法院裁决

在实际案例中，法院通常会根据相关法律法规和合同约定进行裁决。特别是当合同已经过备案，且备案合同与中标通知书或后续合同存在不一致时，法院倾向于以备案合同为准。这有助于维护建筑市场秩序，防止“阴阳合同”等损害他人合法权益的行为。例如，在某建筑工程项目中，若招标文件规定工程质量标准为优质工程，而合同降低为合格工程，且合同已经过备案，那么在发生纠纷时，法院可能会以备案合同中的优质工程标准为准进行裁决。

四、建议与预防措施

为避免中标通知书与合同的不一致，建议采取以下措施：

1. 加强沟通与明确约定：在招投标和合同签订过程中，双方应加强沟通，确保对合同条款的理解一致，并在合同中明确约定双方的权利义务关系。
2. 严格审查与备案：在合同签订前，双方应严格审查合同条款，确保其与中标通知书的内容一致，并及时办理合同备案手续。
3. 法律意识提升：增强双方的法律意识，了解并遵守相关法律法规，确保招投标和合同签订活动的合法性和规范性。

综上所述，当中标通知书与合同不一致时，需综合考虑不一致的具体内容、产生时间、是否涉及实质性条款以及合同是否经过备案等因素，并根据相关法律法规和合同约定进行准确判断和处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。