结论前置：在违法分包工程已做过结算的情况下，能否要回对方的违法所得，需视具体情况而定，但通常可以通过法律途径追讨。以下从不同角度进行分析：
一、违法分包的法律性质及后果
违法分包，即违反法律法规规定，将工程分包给不具备相应资质条件的单位或个人，或者将工程主体结构分包等行为。根据《中华人民共和国建筑法》及相关法律法规，违法分包是明确禁止的，且会面临行政处罚，包括罚款、没收违法所得等。
二、结算后的违法所得追讨
违法所得的认定：
- 违法所得通常指的是因违法分包行为而获得的额外收益或不当利益。在结算后，如果分包方确实存在违法所得，如通过低价承接工程后高价转包赚取差价等，这部分收益是可以被追讨的。
追讨途径：
- 行政途径：可以向相关建设行政主管部门举报违法分包行为，要求行政部门对违法分包方进行处罚，并追缴其违法所得。
- 民事途径：如果因违法分包行为导致工程质量问题、工期延误等损失，发包方或承包方（如总承包方）可以向违法分包方提起民事诉讼，要求其赔偿损失，并可能包括追讨其违法所得部分（如果这部分所得与损失有直接关联）。
- 刑事途径：在极端情况下，如果违法分包行为构成犯罪（如串通投标罪、行贿罪等），则可以向公安机关报案，追究违法分包方的刑事责任，并可能通过刑事附带民事诉讼追讨违法所得。
证据收集：
- 在追讨违法所得的过程中，证据的收集至关重要。包括但不限于分包合同、结算单据、付款凭证、沟通记录、工程质量检测报告等，这些证据将有助于证明违法分包行为的存在以及违法所得的具体数额。
三、实际操作中的注意事项
- 及时行动：一旦发现违法分包行为，应尽快采取行动，以免因时间拖延导致证据灭失或违法所得被转移。
- 专业协助：由于法律程序复杂且专业性强，建议寻求专业律师的协助，以确保追讨过程的合法性和有效性。
- 综合考虑：在追讨违法所得的同时，还需综合考虑其他因素，如工程进度、质量、安全等，以确保整体工程项目的顺利进行。
进一步建议：如果您面临违法分包工程已做过结算，想要追讨对方违法所得的情况，建议您直接向我咨询，提供详细的案情和证据材料，以便我能够为您提供更具体、更专业的法律建议。