针对厂房无合法来源的问题，首先明确结论：厂房无合法来源可能涉及违法建设、产权纠纷及行政处罚等多方面法律风险，需根据具体情况采取相应措施。
一、违法建设风险
法律背景：
- 根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，未经规划、建设等部门批准擅自建设的厂房，属于违法建筑。
法律后果：
- 违法建筑可能面临被责令停止建设、限期拆除、罚款等行政处罚。
- 若厂房已投入使用，还可能因违法建设被要求停止使用，影响正常生产经营。
建议措施：
- 立即停止建设或使用，避免进一步扩大损失。
- 咨询当地规划、建设等部门，了解补办手续的可能性及流程。
- 若无法补办手续，应考虑拆除或转让，以减少损失。
二、产权纠纷风险
法律背景：
- 厂房无合法来源可能意味着产权不明确或存在争议，如土地使用权、房屋所有权等。
法律后果：
- 产权纠纷可能导致厂房被查封、拍卖或强制执行，影响企业正常运营。
- 在产权纠纷中，企业可能面临诉讼风险，需承担诉讼费用及可能的赔偿责任。
建议措施：
- 尽快核实厂房的产权状况，包括土地使用权证、房屋所有权证等。
- 若产权存在争议，应积极与相关方协商解决，或通过法律途径解决纠纷。
- 在产权纠纷解决前，谨慎处理厂房的转让、抵押等行为，避免进一步加剧纠纷。
三、行政处罚风险
法律背景：
- 厂房无合法来源可能违反土地管理、城乡规划、环境保护等多方面的法律法规。
法律后果：
- 除上述违法建设风险外，还可能面临其他行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 行政处罚记录可能影响企业的信用评级，进而影响企业的融资、招投标等经营活动。
建议措施：
- 主动配合相关部门的调查，如实说明情况，争取从轻或减轻处罚。
- 积极整改，消除违法状态，如补办手续、拆除违法建筑等。
- 加强内部管理，确保未来厂房的建设、使用等符合法律法规要求。
四、综合建议
- 全面审查：对厂房的合法性进行全面审查，包括土地使用权、建设规划、环保要求等方面。
- 专业咨询：咨询专业律师或相关机构，了解具体法律风险及应对措施。
- 合规经营：在未来的经营活动中，确保厂房的建设、使用等符合法律法规要求，避免类似问题再次发生。
若您在厂房合法性方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。