针对您提出的“企业破产违法厂房怎么办”这一问题，首先需要明确的是，企业破产时，其所有资产，包括厂房，都需要纳入破产清算程序进行处理。这里的“违法厂房”可能指的是存在某些法律瑕疵或违规建设的厂房，但即便如此，在破产清算过程中，仍需遵循相关法律法规进行妥善处理。

以下是企业破产时，厂房（包括可能存在的违法厂房）的一般处理流程：

1. 纳入破产清算范围：

   • 企业破产后，其所有资产，包括厂房，都需要被纳入破产清算范围。清算组将负责评估和处理这些资产。

2. 评估与清理：

   • 清算组会首先催告债权人申报债权，并调查和清理公司的所有财产，包括厂房。对于可能存在的违法厂房，清算组也会进行详细的调查和评估，以确定其法律状态和价值。

3. 制定清算方案：

   • 在制定清算方案时，清算组会明确厂房的处理方式。这可能包括出售、转让、拆除（如果违法建设严重且无法合法化）或以其他方式变现。对于违法厂房，如果其违法性质可以通过补办手续等方式合法化，清算组可能会考虑采取相应措施使其合法化后再进行处置；如果无法合法化，则可能需要根据相关法律法规进行拆除或其他处理。

4. 清偿债务：

   • 厂房处置所得款项将用于清偿公司债务。如果公司财产不足以清偿债务，清算组有责任向人民法院申请宣告破产，并按照法定的破产程序处理厂房等财产。

5. 遵循法律法规：

   • 在整个处理过程中，必须严格遵循相关法律法规，如《中华人民共和国企业破产法》等，确保处理程序合法合规。对于违法厂房的处理，还需特别注意遵守城乡规划法、建筑法等相关法律法规。

6. 特殊情况处理：

   • 如果厂房存在严重的违法问题，如未经批准擅自建设、占用公共土地等，清算组在处理时可能需要与相关部门沟通协调，确保处理方式符合法律法规要求，并尽可能减少对周边环境和利益相关者的影响。

综上所述，企业破产时，厂房（包括可能存在的违法厂房）的处理需要遵循严格的法律法规和破产清算程序。清算组将负责评估和处理这些资产，并确保处理过程合法合规。对于违法厂房的处理，还需根据具体情况采取相应措施，确保符合法律法规要求。