厂房被没收并罚款后，您应当根据具体情况采取以下措施：

1. 确认行政行为的合法性
   首先，您需要确认没收厂房和罚款的行政行为是否合法。这包括审查行政机关是否具有相应的执法权限、是否遵循了法定程序（如是否出具了书面决定、是否告知了救济权利等）、以及处罚依据是否充分（如是否符合《行政处罚法》《土地管理法》《城乡规划法》等相关法律法规的规定）。如果行政行为存在程序违法或实体违法（如超越职权、适用法律错误、处罚明显不当等），您有权依法提出异议。

2. 依法行使救济权利
   如果对没收和罚款决定不服，您可以通过以下途径维护自身权益：

   • 申请行政复议：在收到处罚决定书之日起60日内，向作出处罚决定的行政机关的上一级主管部门或同级人民政府申请复议，请求撤销或变更处罚决定。
     
   • 提起行政诉讼：在收到处罚决定书之日起6个月内，直接向人民法院提起行政诉讼，要求法院审查行政行为的合法性。如果法院认定行政行为违法，可能会判决撤销处罚决定或确认其无效。
     
   • 申请听证：在处罚决定作出前，如果您认为处罚可能对自身权益产生重大影响，可以依法申请听证，通过口头陈述、举证等方式维护自身立场。

3. 评估损失并协商补偿（如适用）
   如果厂房被没收导致您的财产权益受损，且行政行为被确认违法或存在过错，您可以依法主张行政赔偿。根据《国家赔偿法》，行政机关及其工作人员在行使职权时侵犯公民、法人或其他组织合法权益的，受害人有权取得赔偿。您需要收集相关证据（如厂房权属证明、处罚决定书、损失清单等），向赔偿义务机关提出赔偿申请，或在行政诉讼中一并提起赔偿请求。

4. 整改违规行为（如存在）
   如果厂房被没收和罚款是因为您存在违法建设、未取得合法手续等违规行为，您需要积极整改，避免进一步法律风险。例如，如果厂房属于违法建筑，您可能需要配合拆除或补办相关手续；如果涉及环保、安全等问题，您需要完善合规措施，确保后续经营符合法律法规要求。

5. 咨询专业律师，制定应对策略
   由于行政处罚涉及复杂的法律程序和实体问题，建议您及时咨询专业律师，全面评估案件情况，制定针对性的应对策略。律师可以帮助您分析行政行为的合法性、准备复议或诉讼材料、参与听证或谈判，并协助您主张合法权益。

总结：厂房被没收并罚款后，您应首先确认行政行为的合法性，依法行使复议或诉讼等救济权利，同时评估损失并协商补偿（如适用）。如果存在违规行为，需积极整改以避免进一步风险。如有需要，请随时向我咨询，我将为您提供详细的法律分析和应对建议。