违法建筑的估值通常无法直接通过常规方法确定，因其本身不具备合法产权，但可根据实际情况，通过成本法、市场比较法（有限适用）等方式进行估算，且需结合行政机关的认定与处理结果综合判断。以下为具体分析：

1. 成本法估算
   违法建筑虽无合法产权，但若需估算其“价值”（如涉及赔偿、拆除补偿等争议），可参考建造时的实际成本，包括：

   • 材料费：如水泥、钢材、砖瓦等建材费用；
     
   • 人工费：施工人员的劳务费用；
     
   • 其他费用：如设计费、运输费等。
     注意：此方法仅估算物理成本，不考虑土地价值、规划许可等合法权益，且若建筑因违法被强制拆除，成本可能无法获赔。

2. 市场比较法（有限适用）
   若违法建筑所在区域存在类似违法建筑交易（如小产权房私下交易），可参考市场行情估算，但需注意：

   • 此类交易本身违法，不受法律保护；
     
   • 估值结果可能因政策变化（如强制拆除、没收）而失效。
     示例：某地区违法搭建的商铺因拆迁引发补偿争议，可参考周边类似违法商铺的“租金”或“转让费”估算，但最终需以行政机关认定为准。

3. 行政机关认定与处理结果的影响
   违法建筑的估值需以行政机关的认定为基础：

   • 限期改正：若建筑可通过补办手续合法化，估值可能包含补办费用及合理成本；
     
   • 罚款+保留：若被罚款后允许保留使用，估值可能扣除罚款部分；
     
   • 强制拆除：若被责令拆除，建筑本身价值可能归零，仅可能获赔残值（如建材回收价值）。
     关键点：行政机关的处罚决定直接影响估值逻辑，需优先遵循。

4. 司法实践中的参考
   在诉讼中，法院可能委托专业机构对违法建筑进行评估，但评估目的通常限于：

   • 确定拆除成本（如由违法者承担拆除费用）；
     
   • 计算因拆除导致的损失（如合法经营场所的停业损失）。
     原则：司法评估不认可违法建筑的“市场价值”，仅评估实际损失或成本。

建议：若涉及违法建筑估值争议（如拆迁补偿、侵权赔偿），需结合具体场景、行政机关处理结果及司法实践综合判断。如有具体问题，可直接向我咨询，我会结合您的案例细节提供进一步分析。