评估公司对违章建筑通常不会进行正式估价，因为违章建筑本身不具备合法产权，无法按照合法建筑的标准进行价值评估。不过，为了更全面地解答这个问题，我们可以从以下几个角度进行分析：

一、违章建筑的法律性质

违章建筑，顾名思义，是指未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的建筑物。根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，违章建筑可能面临限期改正、罚款、限期拆除或没收实物等法律后果。因此，从法律角度讲，违章建筑并不具备合法产权，其价值也无法通过正规渠道进行评估。

二、评估公司的角色与限制

评估公司的主要职责是对具有合法产权的财产进行价值评估，为交易、抵押、拍卖等提供价值参考。然而，对于违章建筑，由于它们不具备合法产权，评估公司通常不会对其进行正式估价。这是因为评估公司需要遵循相关法律法规和行业规范，确保评估结果的合法性和准确性。如果评估公司对违章建筑进行估价，可能会面临法律风险和行业纪律处分。

三、特殊情况下的处理

尽管评估公司通常不会对违章建筑进行正式估价，但在某些特殊情况下，如拆迁补偿、纠纷解决等，可能需要对违章建筑的价值进行某种形式的“评估”。这种情况下，评估可能更多是基于建筑的实际使用价值、建造成本、市场情况等因素进行的一种非正式估算，而非严格意义上的价值评估。这种估算结果通常不具有法律上的强制执行力，但可以作为协商或调解的参考依据。

四、法律建议

1. 对于违章建筑的所有者：建议尽快与相关部门沟通，了解违章建筑的处理方式和可能的法律后果。如果可能的话，尽量通过合法途径补办相关手续，使建筑合法化。
2. 对于需要处理违章建筑的情况：如拆迁、纠纷等，建议咨询专业律师，了解相关法律法规和程序，确保自身权益得到合法保护。
3. 对于评估公司：在接到涉及违章建筑的评估请求时，应明确告知客户违章建筑的法律性质和评估限制，避免陷入法律风险。

总结来说，评估公司通常不会对违章建筑进行正式估价，因为违章建筑不具备合法产权。在处理涉及违章建筑的问题时，建议各方遵循相关法律法规和程序，确保自身权益得到合法保护。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。