仲裁员不能以员工身份代理本仲裁委的案件。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
法律角度
回避制度：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第三十三条的规定，仲裁员有下列情形之一，应当回避，当事人也有权以口头或者书面方式提出回避申请：
- 是本案当事人或者当事人、代理人的近亲属的；
- 与本案有利害关系的；
- 与本案当事人、代理人有其他关系，可能影响公正裁决的；
- 私自会见当事人、代理人，或者接受当事人、代理人的请客送礼的。
- 虽然该条款并未直接提及仲裁员不能以员工身份代理本仲裁委的案件，但仲裁员作为仲裁委的组成部分，其身份本身就与仲裁委存在紧密的利益关联。若仲裁员以员工身份代理本仲裁委的案件，很可能引发对公正裁决的质疑，从而违反回避制度的精神。
代理权限与身份冲突：
- 仲裁员在仲裁委中扮演的是裁决者的角色，其职责是公正、公平地审理案件并作出裁决。
- 若仲裁员以员工身份代理案件，则其身份将发生转变，从裁决者变为当事人一方的代理人。这种身份冲突很可能导致仲裁员在审理案件时无法保持公正和客观，从而损害仲裁的公正性和权威性。
实践角度
仲裁委的内部规定：
- 大多数仲裁委都会制定内部规定，明确禁止仲裁员以任何形式代理本仲裁委的案件。这是为了维护仲裁的公正性和权威性，防止仲裁员利用其身份优势谋取不正当利益。
行业惯例与职业道德：
- 在法律行业，仲裁员作为独立的第三方，其职业道德要求其保持公正、客观和独立。若仲裁员以员工身份代理案件，将严重违反这一职业道德要求，损害其在行业内的声誉和信誉。
法律后果
- 若仲裁员违反规定以员工身份代理本仲裁委的案件，可能面临法律责任和纪律处分。这包括但不限于被撤销仲裁员资格、受到行业内的纪律处分以及可能面临的法律诉讼等。
建议：
- 对于仲裁员而言，应严格遵守法律法规和仲裁委的内部规定，保持公正、客观和独立的立场，避免任何可能引发质疑的行为。
- 对于当事人而言，若发现仲裁员存在违规行为，应及时向仲裁委或相关部门提出异议，以维护自己的合法权益。
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