在起诉时，若合同约定的公司注册地址和主要办事机构地址都发生了变更，原则上应以变更前的地址为准进行起诉，但具体还需结合实际情况和法律规定来确定。以下从不同角度为你详细分析：
从起诉受理的角度
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，起诉应当向有管辖权的人民法院提出。对于公司作为被告的案件，通常由被告住所地人民法院管辖。而公司的住所地一般是指其主要办事机构所在地，若主要办事机构所在地难以确定的，则以其注册地或者登记地为准。
若主要办事机构地址变更情况明确且易于确定：
- 在起诉时，如果公司的主要办事机构地址已经变更，且这一变更情况是明确且易于确定的（例如，公司已经在新地址正常办公，且相关工商登记信息也已更新），那么从理论上讲，原告应当向新的主要办事机构所在地的人民法院起诉。但在实际操作中，由于起诉时可能面临信息不对称或变更登记未及时完成等问题，原告可能仍会选择向变更前的地址所在地法院起诉。此时，若法院在受理过程中发现被告主要办事机构地址已变更，可能会根据案件情况，将案件移送至有管辖权的新地址所在地法院。
若主要办事机构地址变更情况不明确或难以确定：
- 如果公司的主要办事机构地址变更情况不明确，或者虽然变更但难以确定新地址的具体位置（例如，公司只是口头宣布变更，但未办理相关工商登记手续，或新地址尚未实际投入使用），那么在这种情况下，原告向变更前的地址所在地法院起诉是更为稳妥的选择。因为根据法律规定，当主要办事机构所在地难以确定时，公司的注册地或登记地将被视为其住所地，从而确定管辖法院。
从诉讼策略的角度
在起诉时，选择向哪个地址的法院提起诉讼，不仅涉及法律问题，还涉及诉讼策略问题。原告在选择起诉法院时，可以考虑以下因素：
- 便利性：选择距离自己较近或交通较为便利的法院，可以减少诉讼成本和时间成本。
- 法院熟悉程度：如果原告对某个法院的审判风格、法官素质等较为熟悉，可能会倾向于选择该法院进行起诉。
- 案件性质：根据案件的具体性质（如合同纠纷的类型、争议焦点等），选择对该类案件有丰富审理经验的法院，可能更有利于案件的公正审理和顺利解决。
实际操作建议
- 在起诉前尽量收集被告的最新信息：包括公司的主要办事机构地址、注册地址、联系方式等，以便准确确定起诉法院。
- 如果无法确定被告的主要办事机构地址：或者该地址已变更且难以确定新地址，可以向被告的注册地或登记地法院起诉。
- 在起诉过程中：如果发现被告的主要办事机构地址已变更，且新地址明确且易于确定，可以及时向法院申请变更管辖法院。
最后需要强调的是，法律问题往往具有复杂性和多变性，每个案件的具体情况都可能有所不同。因此，在处理类似问题时，建议你直接向我咨询，以便我能根据你的具体情况提供更为准确和全面的法律建议。