关于开发票时要求出示营业执照和在职证明是否合法的问题，这主要取决于具体的开票情境和税务机关的相关规定。以下是对此问题的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在正常的商业交易中，开发票通常不需要提供营业执照和在职证明。一般来说，销售方在开具发票时，主要需要确认的是购买方的身份信息（如名称、纳税人识别号等，对于个人则主要是姓名和身份证号码）以及交易的具体内容（如商品或服务的名称、数量、单价、金额等）。这些信息通常通过销售方的销售记录、合同、订单或购买方的付款凭证等来确认。
然而，在某些特定情况下，税务机关或相关机构可能会要求提供额外的证明材料。例如：
代开发票的情况：如果销售方没有领购发票或者领购的发票不足以满足当前交易的需求，可能需要向税务机关申请代开发票。在这种情况下，税务机关可能会要求提供一些证明材料来确认交易的真实性和合法性。但根据《国家税务总局关于加强和规范税务机关代开普通发票工作的通知》的规定，这些证明材料通常包括申请代开发票人的合法身份证件和付款方（或接受劳务服务方）对所购物品品名（或劳务服务项目）、单价、金额等出具的书面确认证明，而并不包括营业执照和在职证明。
特殊行业或交易：对于某些特殊行业或交易类型，如大额交易、跨境交易或涉及特定税收优惠政策的交易等，税务机关可能会要求提供更多的证明材料来确保税收的合规性。但即便如此，营业执照和在职证明也通常不是必需的，除非这些文件能够直接证明交易的真实性和合法性。
内部管理要求：有些企业或机构在内部管理上可能要求员工在开具发票时提供额外的证明材料，如在职证明等，以作为报销或审计的依据。但这并不属于税务机关的法定要求，而是企业或机构自身的内部管理规定。
综上所述，从税务机关的角度来看，开发票通常不需要提供营业执照和在职证明。如果遇到要求提供这些文件的情况，建议首先确认该要求是否来自税务机关，并了解其具体的法律依据。如果认为该要求不合理或无法提供相关文件，可以与税务机关进行沟通协商，或者寻求专业的税务咨询帮助。同时，也建议企业或机构在内部管理上合理设置开票流程和要求，以确保既符合税务法规的要求，又方便员工的实际操作。