当中标后过了公示期甲方废标，这确实是一个涉及法律权益保护的问题。首先，我们要明确的是，甲方这种单方面废标的行为，在法律上构成违约，需要承担相应的赔偿责任。
一、赔偿原则与法律依据
合同约定优先：
- 如果双方已经签订了书面合同，并且合同中明确约定了违约责任条款，那么赔偿应按照合同约定来执行。
- 法律依据主要是《中华人民共和国招标投标法》第四十六条，它要求招标人和中标人必须按照招标文件和中标文件来订立书面合同，违约方需要承担法律责任。
协商与调解：
- 如果合同中没有明确约定违约责任，双方应首先尝试通过协商来解决赔偿问题。
- 协商不成的话，可以寻求第三方的调解机构介入，比如行业协会或者专业调解中心。
诉讼或仲裁：
- 如果协商和调解都没有结果，乙方可以根据合同中是否有仲裁条款，选择向指定的仲裁机构申请仲裁，或者直接向有管辖权的人民法院提起诉讼。
- 法律依据是《中华人民共和国民法典》以及相关的仲裁法规。
二、赔偿范围
赔偿范围主要包括直接损失和间接损失：
直接损失：
- 包括投标成本，比如购买标书、资料印刷、人工成本等。
- 投标保证金的利息损失。
- 为履行合同而已经支出的费用，比如采购设备、材料费、租赁场地设备费、招聘培训人员费用等。
间接损失（可得利益损失）：
- 主要是指乙方如果正常履行合同可以获得的利润，这个通常可以按照行业平均利润率或者乙方过往类似项目的利润率来进行合理估算。
- 还包括因项目取消导致的后续业务机会丧失、声誉损失以及处理取消事宜的合理费用。不过，间接损失的计算和认定相对复杂，需要乙方提供充分的证据来支持。
三、特殊情况的考虑
不可抗力：
- 如果项目取消是因为不可抗力造成的，甲方仍然需要赔偿乙方的经济损失，但通常不包括利润损失。
- 具体的赔偿范围需要根据合同约定和法律规定来确定。
招标代理服务费：
- 如果项目取消导致乙方支付了不必要的招标代理服务费，乙方有权要求招标人或者招标代理机构进行适当的补偿，这个具体依据三方的约定来执行。
四、赔偿程序与操作建议
及时书面提出赔偿要求：乙方在发现甲方取消项目后，应及时向甲方以书面形式提出赔偿要求，并详细阐明损失的构成和计算依据。
收集并保存证据：乙方应收集并保存所有与项目取消相关的证据，包括但不限于合同、投标文件、费用支出凭证、利润估算报告等，以备协商、调解、仲裁或诉讼之需。
积极参与协商与调解：在协商和调解过程中，乙方应积极参与，表达自己的合理诉求，并尝试与甲方达成赔偿协议。
依法维权：如果协商和调解都没有结果，乙方应依法向仲裁机构或人民法院提起仲裁或诉讼，以维护自身的合法权益。
综上所述，中标后甲方废标构成违约，需要依法承担赔偿责任。乙方在处理这类问题时，应综合考虑合同约定、实际损失、特殊情况以及法律规定等因素，采取合适的措施和策略来维护自身的权益。