公司安排调休扣底薪是否合法，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、因公司原因调休

1. 一个工资支付周期内

   • 结论：若公司因自身原因（如订单不足、设备检修等）安排员工调休，且时间未超出一个工资支付周期，公司应按劳动合同约定的标准支付员工工资，此时扣底薪不合法。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，用人单位应按月足额支付劳动者工资，不得无故克扣。
   • 示例：月工资约定为6000元，若在此周期内调休，员工应获全额6000元工资，公司不得扣减底薪。

2. 超过一个工资支付周期

   • 结论：若调休时间超出上述周期，员工提供正常劳动时，公司支付的报酬不得低于当地最低工资标准；若员工未提供正常劳动，公司应按当地规定支付生活费，标准通常不低于最低工资的一定比例（如70%-80%，具体依地方规定）。在此情况下，按规定支付生活费或不低于最低工资标准的报酬，扣底薪不属于违法；反之，则不合法。
   • 法律依据：相关劳动法规对超过一个工资支付周期后的工资支付有明确规定，旨在保障劳动者的基本生活需求。
   • 示例：若当地最低工资标准为2000元/月，公司因自身原因安排员工调休超过一个工资支付周期，且员工未提供正常劳动，公司应支付的生活费不得低于1400元/月（按70%计算）。若公司扣减底薪导致员工实际收入低于此标准，则构成违法。

二、因员工个人原因调休

• 结论：若员工因个人原因（如事假）申请调休，公司可根据规章制度扣除相应底薪，但需满足以下条件：规章制度需经民主程序制定，并向员工公示告知；扣除标准应合理，不得过度克扣。
• 法律依据：员工因个人原因请假，属于违反公司考勤制度的行为（若未经批准），公司有权根据规章制度进行相应处理。但处理方式需合法合规，不得侵犯员工的合法权益。
• 示例：若公司规章制度规定，员工因事假请假，每天扣除底薪的1/30（假设月工作天数为30天），且该制度已向员工公示告知，则公司按此标准扣除底薪是合法的。但若扣除比例过高或未经公示告知，则可能构成违法。

三、劳动者维权途径

• 协商沟通：面对公司不当扣薪行为，劳动者首先应与公司协商沟通，要求说明扣薪原因并提供依据。
• 投诉举报：协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护合法权益。
• 法律诉讼：必要时，劳动者可通过法律途径进一步追究责任，如向法院提起诉讼。

总结与建议：公司安排调休扣底薪的合法性取决于具体情形。劳动者应了解自身权益，并在权益受损时积极采取措施保护自己的合法权益不受侵犯。若对公司扣薪行为有疑问或不满，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和维权建议。