在起诉离婚期间，如果一方拒不到庭导致法院无法判决离婚，且双方处于分居状态，孩子抚养权的归属问题，主要依据的是孩子的最佳利益原则，并结合双方的具体情况来综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 法院判决抚养权的基本原则：

   • 法院在判决抚养权时，首要考虑的是孩子的最佳利益。这包括但不限于孩子的生活环境、教育条件、身心健康状况，以及父母双方的抚养能力和抚养意愿等。
   • 如果一方拒不到庭，这通常不会直接影响抚养权的判决，但法院会通过其他方式（如询问另一方、调查取证等）来了解双方的情况，以便作出更公正的判决。

2. 分居状态对抚养权判决的影响：

   • 分居本身并不直接决定抚养权的归属，但分居期间双方对孩子的抚养情况（如谁实际照顾孩子、谁承担了更多的抚养责任等）会成为法院考虑的重要因素。
   • 如果一方在分居期间能够证明自己更适合抚养孩子（如提供了更好的生活环境、教育条件等），那么这一方在抚养权判决中可能会占据更有利的地位。

3. 拒不到庭的法律后果与抚养权判决：

   • 拒不到庭通常被视为对诉讼权利的放弃，但这并不意味着法院会直接判决另一方获得抚养权。法院仍然会依据孩子的最佳利益原则，结合双方的具体情况来作出判决。
   • 如果拒不到庭的一方在分居期间对孩子缺乏关心和照顾，或者存在不利于孩子成长的行为（如虐待、遗弃等），那么这些行为可能会成为法院判决抚养权时考虑的不利因素。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于希望获得抚养权的一方，建议积极收集证据，证明自己更适合抚养孩子。这可以包括提供孩子的生活照片、视频、学校记录、医疗记录等，以证明自己与孩子之间的亲密关系以及自己为孩子提供的良好生活环境。
   • 同时，也可以尝试与对方进行协商，寻求达成抚养权的协议。如果协商不成，再向法院提起诉讼，并准备好充分的证据来支持自己的主张。

总结来说，在起诉离婚期间且双方分居的情况下，孩子抚养权的归属主要依据孩子的最佳利益原则，并结合双方的具体情况来综合判断。拒不到庭本身不会直接决定抚养权的归属，但可能会影响法院对双方情况的判断。因此，建议双方都积极参与到诉讼中来，为孩子的未来负责。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。