结论前置：合同中约定了“双方盖章签字后生效”，但实际只盖了公章没有法人章（或法人签字），合同是否有效需根据具体情况综合判断。在大多数情况下，仅加盖公章合同即可生效，但也存在特殊情形导致合同无效或效力待定。以下是对此问题的详细分析：

合同有效的情况

1. 公章的法定效力：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。公司公章作为公司对外意思表示的重要凭证，具有代表公司的法定效力。因此，合同上加盖公司公章，即使没有法人签字或法人章，也通常视为公司对合同内容的认可和承诺，合同依法成立并生效。

2. 符合交易习惯或授权：

   • 在商业实践中，如果双方根据交易习惯或以往合作模式，认可仅加盖公章即可使合同生效，那么此类合同有效。
   • 若公司内部有明确规定，授权特定人员使用公章签订合同，则此类合同同样有效，无需法人额外签字或加盖法人章。

3. 履行治愈规则：

   • 在签名、盖章或按指印之前，如一方已履行主要义务且对方接受，该合同也被视为已成立，即实际履行可以弥补形式上的不足。例如，合同签订后，一方已按合同约定履行了主要义务，另一方也接受了履行，那么即使合同上只有公章没有法人签字或法人章，合同也依然有效。

合同可能无效或效力待定的情况

1. 公章被伪造或盗用：

   • 如果公章被他人伪造或盗用后加盖在合同上，且公司对此并不知情且未追认，则该合同无效。因为此时的盖章行为并非公司的真实意思表示。

2. 存在法定无效事由：

   • 合同内容若违反法律法规的强制性规定，或存在恶意串通、损害国家、集体或第三人利益等法定无效情形，即使加盖了公章，合同也无效。

3. 合同约定特别生效条件：

   • 当事人在合同中特别约定了合同必须在签字并加盖公章（或加盖法人章）后才生效的情况下，仅有公章而没有法人签字或法人章的合同不会生效。这是尊重当事人意思自治的体现。例如，合同中明确写明“本合同自双方签字并盖章（包括公章和法人章）之日起生效”，那么仅盖公章而无法人签字或法人章，合同将未达到约定的生效条件，因此不生效。

实例说明与建议

• 实例说明：假设甲公司与乙公司签订了一份买卖合同，合同中约定了“双方盖章签字后生效”，但实际签订时只盖了甲公司的公章，没有甲公司法人的签字或法人章。如果乙公司对此没有异议，且合同内容合法合规，双方也按照合同约定履行了各自的义务，那么这份合同就是有效的。但如果乙公司对此提出异议，或者合同内容存在违法情形，或者甲公司的公章是被伪造或盗用的，那么这份合同就可能无效或效力待定。

• 建议：为避免不必要的纠纷，建议在签订合同时明确约定合同的生效条件，并确保合同内容合法合规。同时，公司在管理公章时应加强内部控制，防止公章被滥用或盗用。如果合同签订或履行过程中遇到任何疑问或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供准确的法律意见和帮助。

综上所述，合同中约定了“双方盖章签字后生效”，但实际只盖了公章没有法人章（或法人签字），合同是否有效需根据具体情况综合判断。在大多数情况下，仅加盖公章合同即可生效，但也存在特殊情形导致合同无效或效力待定。因此，在签订合同时务必谨慎对待每一个条款和细节。