核心结论：若三方协议盖了倒闭公司的章，协议效力可能受影响，但具体需分情况判断，可通过确认公司状态、协商、诉讼等途径解决。以下是详细分析：

1. 确认公司当前法律状态 首先需核实盖章公司是否确实已进入破产程序或被注销。可通过国家企业信用信息公示系统查询企业登记状态，若显示”注销”“吊销”或”破产清算”，则公司已丧失民事主体资格，其盖章行为原则上无效。若公司仅经营困难但未注销，仍具有民事主体资格，盖章行为可能有效。

2. 协议效力分情况判断

   • 公司已注销/破产：根据《民法典》第59条，法人终止后民事权利能力消灭，其盖章行为无法产生法律效力。此时需审查其他两方是否已履行主要义务，若已实际履行（如一方已付款、另一方已提供服务），可主张按事实合同关系处理；若未履行，协议自始无效。
   • 公司未注销但经营异常：若公司虽未注销但被列入经营异常名录，其盖章行为仍可能有效，但需结合具体条款判断。例如，若协议约定”盖章即生效”，且公司法定代表人或授权代表签字真实，则协议可能有效；若仅盖公章但无签字，需进一步核实盖章真实性。

3. 解决方案建议

   • 协商补充确认：若公司仍存在，可要求其重新盖章或出具书面确认函，明确协议效力。若公司已进入破产程序，可向破产管理人申报债权，并提供协议、履行凭证等证据。
   • 诉讼救济：若协商无果，可向法院起诉确认协议效力或要求赔偿损失。诉讼中需提供公司状态证明（如工商档案）、协议原件、履行证据（如转账记录、交付凭证）等。若公司已注销，可将其股东列为被告，主张其未依法清算导致损失。

温馨提示：处理此类纠纷时，建议优先通过书面形式固定证据（如邮件、微信记录），并保留协议原件及履行凭证。若涉及金额较大或法律关系复杂，可进一步向我咨询具体操作方案。