关于您提出的“入职两年后申请非工伤手术”的问题，首先需要明确的是，非工伤手术与工伤认定、工伤待遇等流程是无关的。非工伤手术通常指的是因个人健康原因，而非工作原因导致的需要进行的手术。
一、非工伤手术与工伤认定的区别
工伤认定是针对因工作原因受到事故伤害或患职业病的职工，进行的一种法律上的确认。它涉及到职工是否因工作原因受伤，以及受伤的性质和程度，从而决定职工是否能够享受工伤保险待遇。而非工伤手术，则是因为个人健康问题，如疾病、老化等非工作原因导致的，因此不涉及工伤认定。
二、非工伤手术的申请流程
对于非工伤手术，您通常需要按照以下流程进行：
咨询医生：首先，您需要咨询专业的医生，了解您的健康状况是否需要进行手术，以及手术的具体方案、风险、恢复时间等。
与用人单位沟通：在决定进行手术前，建议您与用人单位进行沟通，说明您的情况，并了解公司的相关政策，如病假、医疗期等。这有助于您在手术期间和恢复期间得到必要的支持和理解。
提交手术申请：根据公司的规定，您可能需要提交手术申请，包括医生的诊断证明、手术方案、预计恢复时间等。这一步骤的具体要求可能因公司而异。
等待审批：提交申请后，您需要等待用人单位的审批。审批通过后，您可以按照计划进行手术。
手术及恢复：在手术期间和恢复期间，您需要遵循医生的建议，按时服药、休息，并定期进行复查。
三、注意事项
了解公司政策：不同公司对于员工因健康原因需要手术的政策可能有所不同。因此，在决定进行手术前，建议您详细了解公司的相关政策，以便做好相应的准备。
保持沟通：在手术期间和恢复期间，与用人单位保持沟通是非常重要的。这有助于您及时了解公司的最新政策，同时也能够让公司了解您的恢复情况，为您提供必要的支持。
关注健康：虽然手术是为了解决健康问题，但手术本身也存在一定的风险。因此，在决定进行手术前，请务必咨询专业医生，了解手术的风险和恢复时间，并做好充分的准备。
综上所述，入职两年后申请非工伤手术与工伤认定无关，您需要按照公司的相关政策和医生的建议进行申请和手术。希望这些信息能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。