担保公司收取被担保人的违约金是否合法，主要取决于担保合同中关于违约金的约定是否符合法律法规、公序良俗原则以及是否合理。以下从多个角度进行详细分析：
一、合法的情况
有明确约定且合理
- 担保合同中应明确约定违约金的具体数额或计算方式，这是违约金合法性的基础。例如，可以约定若被担保人未能按时履行主债务，导致担保公司承担担保责任，则需支付一定比例的违约金，该比例应在法律认可的范围内，通常与可能造成的损失相当，以起到约束和补偿作用。
- 只要违约金的约定不损害国家利益、社会公共利益以及他人合法权益，即具备合法性。
不违反法律法规强制性规定
- 违约金的约定不得违反法律法规的强制性规定，如不得通过违约金条款变相实施高利贷等违法活动。担保公司的经营活动必须处于相关监管部门的有效监管之下，且收取违约金的行为需符合监管规定。
符合公序良俗原则
- 违约金的约定应符合社会公共道德和善良风俗，不得违背社会公平正义。例如，不能约定过于苛刻的违约金条款，使得被担保人在轻微违约时就面临巨额赔偿。
二、不合法的情况
过高且不合理
- 若约定的违约金过高，远远超出了因被担保人违约给担保公司造成的实际损失，被担保人可以向法院或仲裁机构请求适当减少违约金。根据相关法律规定，“过分高于”通常是指超过造成损失的30%，法院或仲裁机构会基于公平原则和实际损失情况对违约金进行调整。
约定不明确或无约定
- 若担保合同中对于违约金没有明确约定，或约定模糊不清，无法确定违约金的具体数额、计算方式等关键要素，则担保公司主张违约金可能得不到法律支持。在这种情况下，担保公司不能单方面要求被担保人支付违约金。
违反法律禁止性规定
- 若违约金的约定违反了法律的禁止性规定，如通过违约金条款掩盖非法目的，进行非法集资等违法活动，则该违约金条款无效，不受法律保护。担保公司不能利用违约金条款进行违法活动，否则将面临法律制裁。
三、实际操作建议
- 仔细审查合同条款：在签订担保合同时，被担保人应仔细审查合同条款，特别是关于违约金的约定。确保违约金条款明确、合理，并符合法律法规和公序良俗原则。
- 及时沟通协商：若对违约金条款有疑问或认为不合理，被担保人应及时与担保公司沟通协商，寻求修改或删除不合理条款。通过友好协商，可以避免后续纠纷的发生。
- 寻求法律帮助：若因违约金问题产生纠纷，被担保人可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。作为专业律师，我可以提供具体的法律建议和帮助。
总结来说，担保公司收取被担保人的违约金是否合法，取决于担保合同中关于违约金的约定是否合法、合理且明确。在面对相关问题时，建议仔细审查合同条款并咨询专业律师（即我本人），以确保自身权益得到妥善保护。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。