若承包土地的实际亩数少于承包经营权证记载的亩数，您有权采取以下措施来维护自身合法权益：

1. 核实与确认差异原因

   • 现场测量与比对：首先，建议您自行或委托专业机构对实际承包的土地进行精确测量，确认实际亩数与权证记载的差异。
   • 查阅相关文件：检查承包合同、权证颁发过程中的相关文件，如土地测量报告、审批文件等，以确定差异是否源于测量误差、记录错误或故意隐瞒。

2. 与发包方协商

   • 沟通协商：在确认差异后，及时与发包方（如村委会、集体经济组织等）进行沟通，说明情况，要求其核实并更正权证记载的亩数。
   • 协商解决方案：双方可协商达成一致，如调整承包费用、补足土地面积或签订补充协议等，以解决亩数不符的问题。

3. 申请行政更正

   • 提交申请：若协商无果，您可向当地农业农村部门或自然资源部门提交书面申请，要求更正承包经营权证上的亩数记载。
   • 提供证据：在申请时，需提供现场测量报告、相关文件等证据，以支持您的更正请求。

4. 法律途径解决

   • 提起行政诉讼：若行政机关未依法履行更正职责，您可依法向人民法院提起行政诉讼，要求法院判决行政机关履行更正职责。
   • 提起民事诉讼：若因亩数不符导致您遭受经济损失，您还可考虑提起民事诉讼，要求发包方赔偿损失。

在处理此类问题时，您还需注意以下几点：

• 保留证据：在整个过程中，务必保留好所有相关证据，如测量报告、沟通记录、申请文件等，以备不时之需。
• 了解法律法规：熟悉《农村土地承包法》、《土地管理法》等相关法律法规，以便更好地维护自身权益。
• 及时行动：发现亩数不符后，应及时采取行动，避免因拖延而丧失维权时机。

若您在处理过程中遇到任何法律难题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。