事业单位在编人员不续聘是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合同到期不续聘的情况
合同约定明确：如果事业单位与在编人员签订的聘用合同中明确约定了合同期限，且合同到期后双方未就续聘达成一致意见，那么事业单位不续聘并不违法。此时，双方应按照合同约定办理终止聘用手续，并可能涉及经济补偿等问题，具体依据《事业单位人事管理条例》等相关规定处理。
合同未明确约定或约定不明：如果合同未明确约定续聘条件或期限，或者约定不明，那么事业单位在合同到期后不续聘可能涉及违法风险。此时，在编人员可以依据相关法律法规，如《事业单位人事管理条例》等，要求事业单位说明不续聘的理由，并可能寻求法律救济。
二、非合同到期不续聘的情况
事业单位单方面解除聘用关系：如果事业单位在合同未到期的情况下，单方面决定不续聘在编人员，且没有合法合理的理由（如在编人员严重违反单位规章制度、不能胜任工作等），那么这种行为可能构成违法解除聘用关系。在编人员可以依法向劳动争议仲裁机构申请仲裁，要求事业单位继续履行聘用合同或支付赔偿金。
在编人员存在过错：如果在编人员存在严重违反单位规章制度、不能胜任工作且经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任、严重失职或营私舞弊给单位造成重大损害等情形，事业单位有权依据相关法律法规和聘用合同的规定，单方面解除聘用关系，即不续聘。这种情况下，事业单位的行为是合法的。
三、法律建议
审查聘用合同：在编人员应首先审查自己与事业单位签订的聘用合同，了解合同中关于续聘、解除聘用关系等条款的约定。
沟通协商：如果事业单位提出不续聘，在编人员应与单位进行沟通协商，了解不续聘的具体原因，并尝试寻求双方都能接受的解决方案。
寻求法律救济：如果认为事业单位的不续聘行为违法，且沟通协商无果，在编人员可以依法向劳动争议仲裁机构申请仲裁，或向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
在处理此类问题时，建议事业单位和在编人员都保持冷静和理性，通过合法途径解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。