事业编干部承包自己工程的行为通常违法，需根据具体情况承担相应法律责任并接受处理。以下从不同角度进行分析：

1. 违反公务员法及事业单位人员管理规定
   根据《中华人民共和国公务员法》第五十九条及《事业单位工作人员处分暂行规定》第十八条，公务员及事业单位工作人员不得违反有关规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务。若事业编干部承包自己管理的工程，属于利用职务便利谋取私利，明显违反上述规定。
   处理方式：由主管部门根据情节轻重给予警告、记过、降低岗位等级、撤职或开除等处分；若涉及金额较大或造成严重后果，可能移送纪检监察机关或司法机关处理。

2. 可能构成贪污贿赂类犯罪
   若承包工程过程中存在虚报工程款、套取国家资金、收受他人财物等行为，可能触犯《刑法》第三百八十二条（贪污罪）、第三百八十五条（受贿罪）或第三百八十七条（单位受贿罪）。例如，通过虚构工程量、伪造合同等方式骗取公共财产，或利用职务便利为他人谋取利益并收受财物。
   处理方式：司法机关将依法追究刑事责任，根据犯罪情节判处刑罚（如有期徒刑、罚金等），并追缴违法所得。

3. 违反招投标法及工程管理制度
   若工程属于必须招标的项目（如使用国有资金、涉及公共利益等），事业编干部通过内部操作使自己承包工程，可能违反《招标投标法》中关于“招标人不得与投标人串通投标”的规定，导致中标无效。
   处理方式：由行政监督部门责令改正，处以罚款；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分；若构成犯罪，依法追究刑事责任。

建议处理步骤：

1. 主动说明情况：若已发生此类行为，建议立即向单位或纪检监察部门报告，配合调查并退还违法所得；
   
2. 接受内部处分：根据单位规定接受警告、记过等处分，避免问题升级；
   
3. 法律风险评估：若涉及刑事犯罪风险，建议委托律师介入，评估证据链完整性及量刑情节，争取从轻处理；
   
4. 完善制度防范：单位应加强工程承包流程监管，明确禁止利益冲突行为，避免类似问题再次发生。

如有具体案件细节或需要进一步分析，可直接向我咨询。