结论：村改居后，村两委通常会被撤销，而居村企业和生产队能否独立存在，需视具体情况和当地政策规定而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 村两委的撤销：

   • 法律依据：根据相关政策及实践，村改居是农村向城市社区转变的过程，通常伴随着村两委（村委会和村党支部）的撤销，并设立新的社区居委会和社区党组织来替代原有的村级组织架构。
   • 实践情况：在多数村改居的案例中，村两委的撤销是村改居工作的重要组成部分，旨在实现农村管理体制向城市社区管理体制的平稳过渡。

2. 居村企业的独立性：

   • 企业性质：居村企业，如果是指原村集体所有的企业，在村改居后，其所有权和经营权可能面临调整。根据当地政策和村改居的具体方案，这些企业可能被改制为股份制企业、有限责任公司或其他形式的企业，其独立性将取决于改制后的企业结构和经营模式。
   • 政策影响：如果当地政策鼓励或要求村集体企业进行改制，并引入外部投资或管理，那么这些企业的独立性可能会受到一定影响。反之，如果政策允许或鼓励企业保持原有经营模式和独立性，那么这些企业可能继续保持独立存在。

3. 生产队的独立性：

   • 生产队性质：生产队作为农村集体经济组织的一种形式，在村改居后，其地位和作用可能发生变化。随着农村管理体制的转变，生产队可能逐渐失去原有的经济职能和管理职能。
   • 政策与实践：在村改居的过程中，生产队可能被整合到新的社区组织中，或者根据当地政策被撤销。然而，如果生产队在村改居后仍然保留有一定的经济活动或管理职能，并且当地政策允许其独立存在，那么生产队可能继续保持一定的独立性。但这种情况相对较少，且通常需要特定的政策支持和组织架构调整。

法律建议：

• 对于居村企业和生产队能否独立存在的问题，建议首先查阅当地村改居的相关政策文件和规定，了解具体政策导向和要求。
• 其次，可以咨询当地政府或相关部门（如农业农村局、民政局等）以获取更详细的信息和指导。
• 如果涉及具体的法律权益保护问题，建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到妥善维护。

可能后果：

• 如果居村企业和生产队在村改居后未能妥善处理其独立性问题，可能面临经营困难、管理混乱等风险。
• 同时，如果未能及时了解和适应当地政策变化，也可能导致企业或生产队在村改居过程中遭受不必要的损失。

因此，在处理村改居过程中居村企业和生产队的独立性问题时，应谨慎对待并寻求专业指导。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。