结论：国企独立法人经理层能否领导不是经理层成员的支委，这并非一个简单的“能”或“不能”的问题，而是需要依据具体的企业治理结构、党组织设置以及相关法律法规和党内规定来综合判断。以下从几个角度进行分析：
企业治理结构与党组织关系：
- 在国有企业中，党组织通常发挥着领导核心和政治核心作用，这是由国有企业的性质和党的领导原则所决定的。然而，企业的具体治理结构，如董事会、经理层等的设置和运作，也会影响到党组织与企业其他管理层的互动关系。
- 如果支委（支部委员会成员）在企业中担任的是非管理职务，或者其职务与经理层无直接隶属关系，那么经理层通常不会直接领导支委。但支委作为党组织的一部分，会在企业决策、监督等方面发挥重要作用，与经理层形成协同或制约关系。
党内规定与职务关系：
- 根据党内相关规定，党组织在企业中的设置和运作应遵循党的组织原则和纪律要求。支委作为党组织的基层组织成员，其职务和职责主要由党内规定来界定。
- 经理层作为企业的管理层，其职责是负责企业的日常经营和管理。在一般情况下，经理层不会直接领导支委，因为支委的职务和职责更多地与党组织相关，而非企业管理。
具体实践中的情况：
- 在实际运作中，国企的党组织和经理层之间往往存在着密切的协作关系。例如，党组织可能会通过参与企业决策、监督企业运营等方式来发挥领导作用，而经理层则会在党组织的领导下负责具体的管理工作。
- 在某些特殊情况下，如果支委同时担任了企业中的管理职务（如部门负责人等），并且该职务与经理层有直接隶属关系，那么经理层可能会在一定程度上对该支委进行领导。但这种情况并不普遍，且需要具体分析。
法律建议：
- 对于国企而言，应明确党组织和经理层的职责和权限划分，确保两者在各自的领域内有效运作，避免职责不清或权限冲突。
- 如果经理层与支委之间存在职务上的交叉或隶属关系，应明确这种关系的性质和范围，并制定相应的管理制度和流程来规范双方的行为。
- 在处理具体问题时，应充分考虑企业的实际情况和党内规定的要求，确保决策和行为的合法性和合规性。
可能后果：
- 如果国企未能正确处理党组织和经理层之间的关系，可能会导致企业决策效率低下、内部矛盾加剧等不良后果。
- 如果经理层或支委超越了各自的职责和权限范围行事，可能会引发法律纠纷或党内纪律处分等后果。
综上所述，国企独立法人经理层能否领导不是经理层成员的支委，需要依据具体情况来判断。在实际运作中，应明确双方的职责和权限划分，确保企业的正常运营和党组织的领导作用得到有效发挥。如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。