医疗机构若使用未注册的执业医师，这一行为属于非法行医的范畴，将面临一系列严重的法律后果。以下是对此问题的详细解析，包括行政责任、民事责任以及刑事责任三个方面，并依据相关法律法规进行说明。
一、行政责任
责令停止非法执业活动：根据《中华人民共和国医师法》及相关规定，县级以上人民政府卫生健康主管部门有权责令使用未注册执业医师的医疗机构立即停止这种非法执业活动，以防止违法行为继续造成危害。
没收违法所得与物品：卫生健康主管部门将没收该医疗机构因使用未注册执业医师而获得的违法所得，同时没收相关的药品和器械，以剥夺其继续从事违法活动的物质基础。
罚款：对于使用未注册执业医师的医疗机构，可并处违法所得二倍以上十倍以下的罚款。如果无法确定违法所得或者违法所得不足一万元，那么将处以一万元以上十万元以下的罚款。
警告、暂停执业及吊销执业证书：根据违法行为的情节轻重，卫生行政部门还可能对医疗机构给予警告、责令暂停6个月以上1年以下执业活动，甚至吊销其医疗机构执业许可证的处罚。
二、民事责任
如果使用未注册执业医师的医疗机构造成了患者的人身损害，那么该医疗机构将构成民事侵权。患者有权依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，要求医疗机构赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。如果造成了残疾或死亡，医疗机构还应赔偿相应的辅助器具费、残疾赔偿金、丧葬费和死亡赔偿金。
三、刑事责任
在情节严重的情况下，使用未注册执业医师的医疗机构还可能构成非法行医罪。根据《中华人民共和国刑法》第三百三十六条，未取得医生执业资格的人非法行医，情节严重的，将面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金的刑罚。如果严重损害了就诊人的身体健康，将处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；如果造成了就诊人的死亡，则处十年以上有期徒刑，并处罚金。
“情节严重”的具体情形包括但不限于：造成就诊人轻度残疾、器官组织损伤导致一般功能障碍；造成甲类传染病传播、流行或有传播、流行危险；使用假药、劣药或不符合标准的卫生材料、医疗器械足以严重危害人体健康；非法行医被行政处罚两次后再次非法行医；以及其他情节严重的情形。
总结与建议
医疗机构使用未注册的执业医师不仅违反了法律法规，还严重威胁了患者的生命安全和身体健康。因此，我建议所有医疗机构在雇佣医师前，务必确认其已经按照相关法规完成了注册手续，确保具备合法的执业资格。同时，相关部门也应加强监管力度，严厉打击非法行医行为，以保障医疗服务的专业性和安全性。