针对您提出的“医疗机构聘用未注册在本机构的医师怎么处罚”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，医疗机构聘用未注册在本机构的医师进行医疗活动，属于违法行为。这种行为不仅违反了《中华人民共和国医师法》的相关规定，也严重威胁到了患者的生命安全和身体健康。

对于这种违法行为，医疗机构将面临以下多方面的处罚：

一、行政责任

1. 责令改正与警告：

   • 县级以上人民政府卫生健康主管部门有权责令医疗机构立即停止聘用未注册医师的行为，并给予警告。

2. 罚款：

   • 根据违法情节的严重程度，医疗机构可能面临罚款。罚款金额可能依据违法所得的倍数进行计算，或者在没有违法所得或违法所得不足一定金额时，处以固定金额的罚款。具体罚款数额可能因地区和具体法规而有所不同，但通常都会较为严厉。

3. 暂停执业或吊销执业许可证：

   • 对于情节严重的医疗机构，卫生健康主管部门可能责令其暂停一定期限的执业活动，甚至吊销其医疗机构执业许可证。

二、民事责任

如果医疗机构聘用未注册医师的行为导致患者人身损害，医疗机构还需要承担民事责任。患者有权依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，要求医疗机构赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。若造成残疾或死亡，医疗机构还应赔偿相应的辅助器具费、残疾赔偿金、丧葬费和死亡赔偿金。

三、刑事责任（针对医疗机构负责人或直接责任人员）

在极端情况下，如果医疗机构聘用未注册医师的行为情节特别严重，且造成了严重后果，医疗机构的相关负责人或直接责任人员可能面临刑事责任。虽然直接的法律条文可能并未明确提及医疗机构负责人因聘用未注册医师而构成的刑事犯罪，但如果该行为导致了严重的医疗事故或患者死亡等后果，相关责任人员可能因“玩忽职守”或“过失致人死亡”等罪名被追究刑事责任。不过，更常见的是，未注册医师本人可能因非法行医罪被追究刑事责任，而医疗机构则承担相应的行政和民事责任。

建议与总结

为了避免上述法律后果，医疗机构应严格遵守相关法律法规，确保所有聘用的医师都具备合法的执业资格，并注册在本机构。同时，医疗机构还应加强内部管理，定期对医师的执业资格进行审查和更新，以确保医疗服务的合法性和安全性。

总之，医疗机构聘用未注册在本机构的医师是违法的，将面临严重的行政、民事乃至可能的刑事责任。因此，医疗机构必须严格遵守相关法律法规，确保医疗服务的合规性和安全性。