针对您提出的“两人虚开发票税款金额50万，其中一人有犯罪前科，另一人没有前科，能否不起诉”的问题，我首先需要明确的是，是否起诉并不完全取决于犯罪嫌疑人是否有前科，而是由多个因素综合决定，包括但不限于犯罪行为的性质、情节、社会危害程度以及犯罪嫌疑人的悔罪表现等。

核心结论：在虚开发票税款金额达到50万的情况下，无论犯罪嫌疑人是否有前科，都可能面临刑事起诉。具体是否起诉，需由检察机关根据案件具体情况和证据材料来决定。

分析说明：

1. 虚开发票的法律后果：

   • 虚开发票是违反国家税收管理法规的行为，情节严重的可能构成犯罪。
   • 税款金额50万属于数额较大的范畴，通常会被视为情节严重。

2. 犯罪前科的影响：

   • 犯罪前科是量刑时考虑的一个因素，但不是决定是否起诉的唯一因素。
   • 有前科可能会加重刑罚，但不影响是否起诉的决策。

3. 不起诉的可能性：

   • 检察机关在决定是否起诉时，会综合考虑案件的具体情况，包括犯罪嫌疑人的悔罪表现、是否积极退赃、是否有自首或立功情节等。
   • 如果犯罪嫌疑人能够证明自己有悔罪表现，积极退赃，或者存在其他可以减轻或免除刑事责任的情形，检察机关可能会作出不起诉的决定。但这并不意味着有前科的人就一定不能获得不起诉的处理。

4. 建议：

   • 对于涉嫌虚开发票的犯罪嫌疑人来说，最重要的是积极配合调查，如实供述自己的罪行，争取从宽处理。
   • 如果担心可能面临的法律后果，建议尽早咨询专业律师，了解具体的法律风险和应对策略。

综上所述，是否起诉并不完全取决于犯罪嫌疑人是否有前科，而是由检察机关根据案件的具体情况和证据材料来综合判断。因此，无法简单地给出“能否不起诉”的答案。如果您或您身边的人面临此类问题，建议尽早咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。