单位自己签的协议，在满足一定条件下是有效的。具体来说，协议的有效性主要取决于以下几个关键因素：
主体适格：
- 单位方面：单位必须是依法设立，具有民事权利能力和行为能力，能够独立承担民事责任的组织，如企业、机关、事业单位、社会团体等。其法定代表人或经过合法授权的代表有权签署协议。
- 个人方面（若协议涉及单位与个人）：个人应具备相应的民事行为能力。完全民事行为能力人可以独立实施民事法律行为；限制民事行为能力人实施的纯获利益或与其能力相适应的民事法律行为有效，其他行为需经法定代理人同意或追认；无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。不过，若协议仅为单位内部行为，不涉及外部个人，则此点主要关注单位内部的决策程序和授权情况。
意思表示真实：
- 协议必须是单位真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫、重大误解等导致意思表示不真实的情形。若存在此类情形，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。例如，单位在受到胁迫的情况下签署了不利于自己的协议，该协议在撤销前虽成立，但可撤销，撤销后则自始无效。
内容合法合规：
- 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家、社会公共利益及他人合法权益。涉及违法犯罪活动或违反法律禁止性、效力性强制性规定的协议无效。例如，单位之间签订的协议若涉及走私、贩毒等违法活动，则该协议自始无效。
形式符合要求：
- 法律、行政法规规定或双方约定采用书面形式的，应当采用书面形式。对于重要事项，为避免争议时举证困难，建议采用书面形式并妥善保存。例如，单位之间的重大合作协议，通常需要采用书面形式，并可能需要进行公证或登记等手续。
可能影响协议有效性的特殊情况：
- 内部决策程序瑕疵：若单位签署协议时未遵循内部决策程序（如未经董事会或股东会决议），可能影响协议的对外效力，尤其是在涉及重大事项时。但内部决策程序的瑕疵通常不影响协议对外部第三方的效力，除非第三方明知或应知该瑕疵。
- 超越经营范围：单位签署的协议若超出其经营范围，但并非国家限制经营、特许经营以及法律、行政法规禁止经营的，通常不影响协议的效力。然而，若协议涉及国家限制经营、特许经营或禁止经营的领域，则可能因违法而无效。
建议：
- 单位在签署协议前，应确保自身具备签署协议的主体资格，并遵循内部决策程序。
- 协议内容应合法合规，不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害国家、社会公共利益及他人合法权益。
- 对于重要事项，建议采用书面形式签署协议，并妥善保存相关证据。
- 若对协议的有效性存在疑问，或协议涉及复杂法律问题，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。