在单位上签的合作协议，一般是有效的，但需满足一定条件。下面我将从多个角度为您详细分析：
一、协议有效的基本条件
双方具备相应民事行为能力：
- 单位作为法人组织，在其经营范围内开展业务、签订协议通常是有行为能力的。但需注意，如果单位存在被吊销营业执照等特殊情况，则可能受限。
- 个人则需达到法定年龄且精神正常，能理解协议内容并承担相应责任。
协议内容是双方真实意思表示：
- 协议应在双方平等自愿的基础上签订，没有受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响。若一方以欺诈手段使对方在违背真实意思情况下签订协议，受欺诈方有权请求撤销。
协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：
- 协议内容必须合法，不能约定从事违法活动。例如，不能约定进行非法传销、生产销售违禁品等行为。
二、协议可能无效或可撤销的情形
显失公平：
- 如果合作协议中权利义务明显不对等，导致一方利益严重受损，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，利益受损方可请求法院或仲裁机构以显失公平为由撤销协议。
违反法律法规强制性规定：
- 如前所述，协议内容若违反法律法规强制性规定，则该协议自始无效。
损害公共利益：
- 协议若损害社会公共利益，如生产和销售严重污染环境的产品，也将被认定为无效。
三、名为合作协议，实为劳动关系的特殊情况
- 如果合作协议实际上符合劳动合同的特征，如个人需遵守用人单位的规章制度、接受其管理、获得劳动报酬等，那么即便签订的是合作协议，也可能被认定为劳动关系，适用劳动法律法规。这种情况下，协议的效力和双方的权利义务将受到劳动法的调整。
四、法律建议
在签订合作协议前，务必仔细审查协议内容：
- 确保协议内容合法、公平，并充分考虑未来可能出现的变化因素。如有必要，可以请专业律师进行审查。
明确约定协议的终止时间或终止条件：
- 这样可以更好地维护各自权益，避免因协议期限不明而产生的纠纷。
在履行协议过程中，双方应遵守诚实信用原则：
- 按照协议约定履行各自义务，如有变更或解除协议的需求，应协商一致并签订书面协议。
举例说明：假设您与一家单位签订了一份技术合作协议，约定双方共同研发一项新技术并分享成果。在签订协议时，您应确保自己具备相应的民事行为能力，协议内容是双方真实意思表示，且不违反法律法规强制性规定。如果协议中约定了“永久有效”，但后续因市场环境变化导致合作无法继续，双方可以协商调整或终止协议。
总结来看，在单位上签的合作协议是否有效，取决于协议双方是否具备相应民事行为能力、协议内容是否是双方真实意思表示、协议内容是否违反法律法规强制性规定以及是否违背公序良俗等多个因素。如果您在签订或履行合作协议过程中遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。