公司自己出的协议，在符合法定条件的情况下是有效的。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议有效的法定条件
根据《民法典》的相关规定，一个有效的民事法律行为（包括协议）需要满足以下条件：
行为人具有相应的民事行为能力：这意味着签订协议的双方（无论是公司还是个人）都必须具备进行民事法律行为的能力。对于公司而言，通常其法定代表人或授权代表具有签订协议的权力。
意思表示真实：协议双方在签订协议时，必须是在自愿、平等、公平的基础上，真实地表达了自己的意愿。如果协议是在欺诈、胁迫或乘人之危的情况下签订的，那么该协议可能是无效的。
不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：协议的内容必须合法，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会的公序良俗。例如，协议中不得包含非法交易、侵犯他人权益等条款。
二、协议起草方对有效性的影响
协议是由公司自己起草的，还是由对方起草，或者是双方共同起草，这并不影响协议的有效性。关键在于协议是否满足了上述法定条件。只要协议双方具备相应的民事行为能力，意思表示真实，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么无论协议是由哪方起草的，都是有效的。
三、实际操作中的注意事项
明确协议条款：在起草协议时，应尽可能明确、具体地约定双方的权利和义务，避免使用模糊、歧义的表述。这有助于减少后续争议的可能性。
审查对方资质：在签订协议前，应对对方的资质、信誉等进行审查，确保对方具备签订协议的资格和能力。
保留证据：在签订和履行协议过程中，应保留好相关证据，如协议文本、往来函件、付款凭证等。这些证据在后续争议解决中可能起到关键作用。
四、可能面临的法律风险及应对
如果协议存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫等），那么一方或双方可能面临法律风险。例如，无效协议可能无法得到法律的保护，一方可能因此遭受经济损失。为应对这些风险，建议在签订协议前进行充分的法律审查，并在发现协议存在问题时及时采取措施，如协商修改、解除协议或寻求法律救济等。
公司自己出的协议在符合法定条件的情况下是有效的。在起草和签订协议时，应严格遵守法律法规，确保协议内容的合法性和有效性。如果您在协议起草或签订过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。