协议书并不因单位只盖章不签字而必然无效。以下从不同角度为你详细分析：
协议生效的一般规定
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同也成立。这意味着，签字或盖章都是使合同成立并生效的有效方式，二者并非必须同时具备。只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方意思表示真实，那么该协议就具备法律效力。
单位盖章不签字的具体情况分析
单位作为协议一方：
- 如果协议中明确约定了“本协议自双方签字或盖章之日起生效”，那么单位盖章即视为对协议的认可，协议自盖章之日起生效，无需再签字。
- 如果协议中仅约定了“本协议自双方签字之日起生效”，但单位实际只盖章未签字，此时需要看双方的实际履行情况。如果单位已经按照协议内容履行了主要义务，且对方接受，那么该协议仍然可以视为成立并生效。因为根据法律规定，当事人一方已经履行主要义务，对方接受的，合同成立。
协议内容与形式的影响：
- 协议的内容是否合法、合规，以及是否双方真实意思的表示，是判断协议是否有效的关键。如果协议内容存在违法、违规情形，或者一方是在被欺诈、胁迫的情况下签订的，那么该协议可能无效或可撤销。
- 协议的形式虽然重要，但并非决定协议是否有效的唯一因素。即使协议形式上存在瑕疵，如单位只盖章未签字，但如果双方已经实际履行了协议内容，且没有争议，那么该协议仍然可以视为有效。
实际操作建议
- 审查协议内容：在签订协议前，务必仔细审查协议内容，确保协议内容合法、合规，且双方意思表示真实。
- 明确生效条件：在协议中明确约定生效条件，如“本协议自双方签字或盖章之日起生效”，以避免后续争议。
- 保留履行证据：在协议履行过程中，注意保留相关证据，如履行凭证、沟通记录等，以证明双方已经实际履行了协议内容。
总结来说，协议书并不因单位只盖章不签字而必然无效。协议的效力取决于其内容是否合法、合规，以及双方是否实际履行了协议内容。如果你对协议的效力存在疑问，或者遇到了相关的法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。