在协议上约定“签字盖章有效”的情况下，仅盖章未签字，合同的效力需根据具体情况判断，一般而言，仅盖章也可认定合同成立并生效，但需注意法律特殊规定及当事人特别约定的情形。以下从不同角度进行分析：
法律规定角度
一般原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一条款明确指出了签名、盖章、按指印三种方式在合同成立上具有同等的法律效力。因此，当协议约定“签字盖章生效”时，盖章这种方式满足了法律规定的合同成立条件，合同一般自成立时生效（除非法律另有规定或当事人另有约定）。
特殊情形：
- 法律、行政法规有特殊规定：若法律、行政法规明确规定合同必须同时签字且盖章才生效，那么仅盖章未签字的协议可能不生效。这类特殊规定通常出现在涉及金融、国有资产交易等特殊领域的合同中。
- 当事人有特别约定：如果协议中明确约定“必须签字并盖章协议才生效”，则仅盖章未签字的协议将被视为未满足生效条件，因此无法产生法律效力。这种约定只要不违反法律、行政法规的强制性规定，即对双方具有约束力。
司法实践角度
- 在实际的司法实践中，对于仅盖章未签字的协议，法院大多会认定其有效性。这是因为盖章行为通常被视为单位或组织对协议内容的认可和同意，具有明确的表意作用。只要所盖的章是真实有效的，且能够代表单位或组织的意志，就可以认定协议已经成立并生效。
特殊情况考虑
- 尽管盖章在大多数情况下足以证明协议的效力，但在某些特殊情况下，如盖章主体的权限问题、印章的真实性争议等，可能会引发法律纠纷。例如，如果盖章的主体没有相应的权限，或者所盖的印章是伪造的，那么该协议可能被视为无效。
操作建议
- 遵循双方约定：在签订协议时，应明确双方在协议生效条件上的约定，如是否要求同时签字和盖章。如果协议上明确要求签字并盖章，应当既签字又盖章，以避免后续可能的争议。
- 确保印章真实性：在使用印章时，应确保印章的真实性和合法性，避免使用伪造或无效的印章。如果可能的话，可以在盖章前对印章进行验证或核实。
- 保留相关证据：在协议签订和履行过程中，应保留好与协议相关的所有证据，如邮件、短信、聊天记录等。这些证据在后续可能发生的争议中可能起到关键作用。
总结：对于“协议上说签字盖章有效，只盖章没签字”的情况，不能一概而论地认为协议无效。而是需要根据具体的法律规定、协议约定以及实际情况来判断协议的效力。为确保协议的合法性和有效性，建议在签订协议时严格遵守相关要求，并在遇到疑问时直接向我咨询。