哺乳假休半个月的扣款方式需根据具体休假类型及单位规章制度确定，以下分情况说明：

1. 若属于法定哺乳假（每天1小时）的延长或集中使用
   根据《女职工劳动保护特别规定》，哺乳期女职工每天享有1小时哺乳时间，多胞胎生育的每多哺乳1个婴儿每天增加1小时。若单位允许将每日哺乳时间集中使用（如半个月内每天不扣1小时，而是集中休半个月），则不应扣发工资，因为这是法定权益的灵活安排。但需注意：

   • 单位需与员工协商一致，并明确书面约定；
     
   • 若单位规章制度或劳动合同中明确禁止集中休假，则可能涉及违规，员工可主张权益。

2. 若属于单位额外批准的“事假性质哺乳假”
   若单位超出法定标准，额外批准员工休半个月假（如员工因特殊原因申请），且明确该假期为“事假”或“无薪假”，则单位可按事假处理，扣发相应工资。扣款标准通常为：

   • 日工资 = 月工资 ÷ 21.75天（法定月计薪天数）；
     
   • 扣款金额 = 日工资 × 休假天数。
     但需注意：单位规章制度需明确此类假期的性质及扣款规则，否则可能因未公示或未协商一致而引发纠纷。

3. 若属于“保胎假”或“病假”与哺乳假重叠
   若员工因身体原因需保胎或治疗，且医生开具病假证明，则休假期间应按病假工资发放（通常为正常工资的60%-100%，具体看单位规定）。若同时处于哺乳期，法定哺乳时间仍应保障，但病假与哺乳假重叠部分可能按病假处理。

建议行动：

• 核对单位规章制度及劳动合同中关于哺乳假、事假、病假的条款；
  
• 与单位人力资源部门沟通，明确休假性质及扣款依据；
  
• 若认为扣款不合理，可收集证据（如休假申请、工资条、规章制度等）向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。