在工程合同约定固定总价结算的情况下，申请鉴定法院是否会支持，需分情况讨论：

1. 合同有效且无变更情形：

   • 法律背景：根据《民法典》及相关司法解释，固定总价合同是双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定时，合同有效。在合同有效且未发生设计变更、工程量增减等情形下，固定总价即为结算依据，法院通常不会支持重新鉴定的申请。
   • 法律建议：在此情况下，若一方申请鉴定，法院可能会以合同已有明确约定为由，驳回鉴定申请。因此，双方应严格遵守合同约定，避免不必要的法律纠纷。

2. 合同有效但存在变更情形：

   • 法律背景：若在合同履行过程中，发生了设计变更、工程量增减等情形，导致原固定总价无法准确反映实际工程成本，此时申请鉴定可能得到法院支持。根据《民法典》第五百四十三条：“当事人协商一致，可以变更合同。”以及第五百六十三条：“因不可抗力致使不能实现合同目的等情形，当事人可以解除合同。”虽然此处未直接提及鉴定，但变更或解除合同后，往往需要重新确定工程价款，鉴定成为必要手段。
   • 法律建议：在此情况下，建议双方先协商确定变更后的工程价款。若协商不成，可申请法院委托鉴定机构进行鉴定，以确定实际工程成本，作为结算依据。

3. 合同无效或存在重大误解、欺诈等情形：

   • 法律背景：若合同因违反法律、行政法规的强制性规定而无效，或者存在重大误解、欺诈等情形，导致固定总价约定显失公平，此时申请鉴定可能得到法院支持。根据《民法典》第一百四十七条至第一百五十一条关于可撤销合同的规定，以及第一百五十三条关于无效合同的规定，受损害方有权请求法院或仲裁机构变更或撤销合同，并重新确定工程价款。
   • 法律建议：在此情况下，受损害方应及时收集证据，证明合同无效或存在可撤销情形，并申请法院委托鉴定机构进行鉴定，以确定实际工程成本，维护自身合法权益。

进一步思考：

• 在工程合同纠纷中，鉴定申请并非随意可提，需满足一定条件。法院在决定是否支持鉴定申请时，会综合考虑合同约定、实际履行情况、双方过错程度等因素。
• 因此，在签订工程合同时，双方应尽可能明确约定工程价款、结算方式等条款，避免模糊不清或存在歧义。同时，在合同履行过程中，应妥善保存相关证据，以备不时之需。

总结：工程合同约定固定总价结算时，申请鉴定法院是否会支持，需根据合同效力、是否发生变更以及是否存在无效或可撤销情形等因素综合判断。若您在此方面遇到法律问题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业法律建议。