将董事会的部分职权授权给经理层，经过股东会决议，这一行为本身并不违法。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法律依据与原则
公司自治原则：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司有权在其章程或通过股东会决议的方式，对公司的经营管理机构及其职权进行配置和调整。这体现了公司自治的原则，即公司有权根据自身经营管理的需要，灵活安排其内部治理结构。
职权分配与调整：董事会作为公司的决策机构，其职权通常包括执行股东会决议、决定公司的经营计划和投资方案等。而经理层则负责公司的日常经营管理。将董事会的部分职权授权给经理层，实际上是对公司内部职权的一种重新分配和调整，这种调整在符合公司章程和法律法规的前提下，是合法且可行的。
二、授权的合法性与程序
股东会决议的合法性：股东会作为公司的最高权力机构，其决议具有法律效力。如果股东会通过决议，将董事会的部分职权授权给经理层，且该决议不违反法律法规和公司章程的规定，那么这一授权行为就是合法的。
授权程序的合规性：在授权过程中，应确保程序的合规性。这包括但不限于：召开股东会会议、提前通知股东、确保股东有充分的时间和机会了解授权事项、按照法定或章程规定的表决方式进行表决等。只有程序合规，才能确保授权行为的合法性和有效性。
三、可能存在的风险与防范
职权滥用风险：虽然将部分职权授权给经理层可以提高公司的运营效率，但也可能存在职权滥用的风险。因此，在授权时，应明确授权的范围、期限和条件，并建立相应的监督机制，以确保经理层在行使职权时不会损害公司和股东的利益。
公司章程的修改：如果授权事项涉及对公司章程的修改或补充，那么应按照法定程序进行修改，并确保修改后的公司章程符合法律法规的规定。
四、实践中的操作建议
明确授权内容：在股东会决议中，应明确授权给经理层的具体职权内容、行使方式、期限和条件等，以避免后续产生争议。
完善内部治理结构：公司应完善其内部治理结构，包括建立健全的监督机制、考核机制等，以确保经理层在行使职权时能够受到有效的监督和约束。
及时履行信息披露义务：如果公司是上市公司或需要履行信息披露义务的其他类型公司，那么在授权后应及时履行信息披露义务，以确保投资者和公众能够及时了解公司的治理结构和职权分配情况。
总结来说，将董事会的部分职权授权给经理层，经过股东会决议，这一行为本身并不违法。但公司在实际操作中应注意授权的合法性、程序的合规性以及可能存在的风险与防范措施。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。