结论：针对开具发票后客户少打几毛钱款项的情况，可采取以下措施处理：

1. 友好沟通协商
   首先建议与客户进行友好沟通，明确告知其实际应付金额与已付金额存在差额（几毛钱），并请求其补足差额。此方式成本最低、效率最高，尤其适用于长期合作或关系良好的客户。沟通时需注意保留书面记录（如微信、邮件等），以备后续可能的需求。

2. 财务内部处理
   若客户拒绝补付或差额金额极小（如低于1元），企业可从财务角度自行消化该差额。根据《企业会计准则》及税务规定，此类微小差额通常不会对财务报表或税务申报产生实质性影响，但需确保账务处理清晰，避免因金额混淆引发后续纠纷。

3. 法律风险防范
   若客户长期存在少付、拒付行为，或差额虽小但涉及频繁交易，需警惕客户可能以“差额”为由主张合同履行瑕疵，进而要求减免其他费用或索赔。此时建议：

   • 在合同中明确约定“付款金额以发票为准”或“差额处理方式”；
     
   • 保留所有交易记录（包括发票、付款凭证、沟通记录等）；
     
   • 若差额累计达到一定金额（如超过100元），可依法主张权利，但需权衡诉讼成本与收益。

提示：实务中，企业常因追求效率或维护客户关系而选择自行承担微小差额，但若差额频繁或客户存在恶意，仍需通过法律手段维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。