结论前置：在贷款被骗起诉对方公司后，是否还能起诉员工，这取决于员工在贷款诈骗行为中的具体角色和责任。如果员工直接参与了诈骗行为，或者其职务行为与诈骗行为有直接关联，那么您是有可能起诉该员工的；反之，如果员工并未直接参与诈骗，且其职务行为与诈骗行为无直接联系，那么起诉员工可能缺乏法律依据。
详细分析：
员工直接参与诈骗行为：
- 如果员工直接参与了贷款诈骗的策划、实施或掩盖等关键环节，那么该员工与诈骗公司构成共同犯罪。在这种情况下，您不仅有权起诉诈骗公司，也有权起诉直接参与诈骗的员工。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，共同犯罪的参与者都应当对其犯罪行为承担相应的刑事责任。同时，在民事诉讼中，您也可以要求该员工承担因其诈骗行为给您造成的损失。
员工职务行为与诈骗行为有直接关联：
- 如果员工虽然未直接参与诈骗行为，但其职务行为（如审核贷款申请、发放贷款等）与诈骗行为有直接关联，且员工在履行职务过程中存在过错或疏忽，导致您遭受损失，那么您可能有权根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，起诉该员工要求其承担相应的民事赔偿责任。但这种情况下的起诉需要证明员工的职务行为与您的损失之间存在直接的因果关系，以及员工在履行职务过程中存在过错或疏忽。
员工未直接参与诈骗且职务行为与诈骗无直接联系：
- 如果员工既未直接参与贷款诈骗行为，其职务行为也与诈骗行为无直接联系，那么起诉该员工可能缺乏法律依据。在这种情况下，员工只是诈骗公司的普通员工，其个人行为并未直接侵害您的权益，因此您可能无法直接起诉该员工。
法律建议：
- 在决定是否起诉员工之前，建议您先收集相关证据，包括员工在诈骗行为中的具体角色、职务行为与诈骗行为的关联性等。这些证据将有助于您判断起诉员工的可行性和胜诉的可能性。
- 如果您认为员工确实应当承担责任，但不确定如何收集证据或如何起诉，建议您咨询专业律师（比如我，侯佳律师，专注于刑事辩护、涉外纠纷、经济纠纷等多个领域，有问题可以直接向我咨询），以获取更具体的法律建议和帮助。
- 在起诉过程中，您需要遵循法律程序和规定，确保起诉的合法性和有效性。同时，您也需要做好应对可能出现的法律风险和挑战的准备。