支付令不在被告所在地，这并不影响支付令的申请与效力，但执行时可能会涉及跨地域的问题。以下是对这一问题的详细分析：
一、支付令的申请与管辖
支付令是人民法院根据债权人的申请，依法作出的督促债务人为一定给付义务的法律文书。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合一定条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令。这里的“有管辖权的基层人民法院”，通常指的是债务人住所地或者合同履行地的基层人民法院。因此，支付令的申请并不受被告所在地（即债务人住所地）的唯一限制，如果合同履行地不在被告所在地，债权人也可以选择在合同履行地的基层人民法院申请支付令。
二、支付令的效力与执行
效力：支付令自作出之日起发生法律效力，债务人应当自收到支付令之日起十五日内清偿债务，或者向人民法院提出书面异议。如果债务人在规定期间内不提出异议又不履行支付令的，债权人可以向人民法院申请执行。
执行：如果支付令不在被告所在地（即债务人住所地）作出，但债务人未在规定期间内提出异议又不履行支付令的，债权人仍然可以向作出支付令的法院申请执行。然而，在实际操作中，如果债务人住所地与作出支付令的法院所在地不一致，可能会涉及跨地域执行的问题。这时，债权人可以依据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，向债务人住所地或者被执行的财产所在地人民法院申请执行。
三、跨地域执行的注意事项
申请执行：债权人需要向有管辖权的人民法院提交申请执行书，并提供相关证据材料，如支付令、债务人的财产线索等。
执行费用：跨地域执行可能会产生额外的执行费用，如差旅费、住宿费等。这些费用通常由被执行人承担，但如果被执行人无力承担或者拒不承担，债权人可能需要先行垫付。
执行难度：跨地域执行可能会增加执行的难度和复杂性。债权人需要与不同地区的人民法院、执行机构等进行沟通协调，确保执行程序的顺利进行。
四、建议与措施
充分准备：在申请支付令前，债权人应充分了解债务人的财产状况和履行能力，以便在支付令生效后能够及时申请执行。
选择管辖法院：如果合同履行地与债务人住所地不一致，债权人可以根据实际情况选择更有利的管辖法院申请支付令。
及时申请执行：一旦支付令生效且债务人未履行义务，债权人应及时向有管辖权的人民法院申请执行，避免错过执行时机。
寻求专业帮助：在跨地域执行过程中，债权人可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。